海洋石油降解菌深海彎曲菌的種類多樣性及地理分布特征分析
本文關(guān)鍵詞: 海洋生物學(xué) 深海彎曲菌 種類多樣性 地理分布特征 表層海水 石油烴 生物降解 出處:《應(yīng)用海洋學(xué)學(xué)報》2017年04期 論文類型:期刊論文
【摘要】:深海彎曲菌(Thalassolituus)是一類海洋專屬的石油降解菌.為認(rèn)識其多樣性與地理分布、獲取石油降解菌資源,本研究對西太平洋和廈門近海的表層海水分別通過石油烴富集和直接涂布石油烴平板,對獲取的菌株進(jìn)行了分離鑒定.在此基礎(chǔ)上,對Gen Bank數(shù)據(jù)庫中該屬的可培養(yǎng)和未培養(yǎng)菌株信息,進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化與物種多樣性分析.結(jié)果表明,從西太富集菌群分離得到的32個菌株中,主要優(yōu)勢菌為假單孢菌(Pseudomonas)和海桿菌(Marinobacter);其次是食烷菌(Alcanivorax)和弧菌(Vibrio).深海彎曲菌僅有2株,但它們代表1個潛在的新種,它們與模式菌株T.marinus IMCC1826T的同源性僅為96.9%和97.0%.從廈門表層海水中分離到1株深海彎曲菌,與模式菌株T.marinus IMCC1826T的相似度為99.66%.基于本研究分離菌株及Gen Bank可培養(yǎng)及未培養(yǎng)菌株的16S rRNA基因序列開展的系統(tǒng)發(fā)育分析表明,該屬存在3個明顯的進(jìn)化分支,即2個模式種T.oleivorans與T.marinus分別代表的2個分支和1個獨立分支;此外,不同分支呈現(xiàn)明顯的地理分布特征,即來自同一緯度范圍的菌株或序列多聚類于同一分支中.我們推測,深海彎曲菌在進(jìn)化過程中,可能因適應(yīng)不同緯度海域的溫度等環(huán)境因子,逐步進(jìn)化出3個不同環(huán)境適應(yīng)性的分支.本研究加深了對深海彎曲菌在不同溫度海洋環(huán)境中種類多樣性分布特征的認(rèn)識,為海洋石油污染生物修復(fù)提供了新資源.
[Abstract]:Thalassolituus (Thalassolituus) is a kind of marine exclusive petroleum degrading bacteria. In order to understand its diversity and geographical distribution, oil degrading bacteria resources are obtained. In this study, the obtained strains were isolated and identified by petroleum hydrocarbon enrichment and direct coating on the surface water of the western Pacific and Xiamen coastal waters, respectively. The phylogeny and species diversity of culturable and uncultured strains in Gen Bank database were analyzed. The results showed that 32 strains were isolated from Xidai enriched flora. The main dominant bacteria were Pseudomonas pseudomonas and Marinobacterus marinobacterus. Alcanivorax) and Vibrio vibrio. There are only two strains of campylobacter in the deep sea, but they represent a potential new species. Their homology with the model strain T.marinus IMCC1826T was only 96.9% and 97.0.A strain of Campylobacter sinensis was isolated from the surface water of Xiamen. The similarity with the model strain T.marinus IMCC1826T is 99.66.The 16s of the culturable and uncultured strains of Gen Bank and the isolated strain based on this study. Phylogenetic analysis of rRNA gene sequence showed that. There are three distinct evolutionary branches in the genus T. oleivorans and T. marinus respectively. In addition, different branches show obvious geographical distribution, that is, strains or sequences from the same latitude range are clustered in the same branch. We speculate that the deep-sea campylobacter is evolving in the process of evolution. May be adapted to different latitude of the sea temperature and other environmental factors. Three branches of environmental adaptability were gradually evolved. This study deepened the understanding of the distribution characteristics of species diversity of Campylobacter sinensis in marine environments at different temperatures. It provides new resources for bioremediation of marine oil pollution.
【作者單位】: 寧波大學(xué)海洋學(xué)院;國家海洋局第三海洋研究所海洋生物遺傳資源重點實驗室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(41206158) 中國大洋專項資助項目(DY135-15-R-01) 國家微生物資源平臺資助項目(NIMR-2017-9)
【分類號】:X172
【正文快照】: (1.寧波大學(xué)海洋學(xué)院,浙江寧波315211;2.國家海洋局第三海洋研究所、海洋生物遺傳資源重點實驗室,福建廈門361005)石油成份復(fù)雜,但主要由烷烴、環(huán)烷烴和芳香烴組成[1].在開采和轉(zhuǎn)運(yùn)過程中發(fā)生的溢油事件,會導(dǎo)致嚴(yán)重的環(huán)境污染,從而引起社會的極大關(guān)注,如2010年墨西哥灣溢油事
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,本文編號:1464995
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