中國象鼻溞屬分子生物地理學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-03 15:56
象鼻溞(Bosmina)是淡水生態(tài)系統(tǒng)中重要的組成部分。作為一個(gè)理想的,象鼻溞已廣泛應(yīng)用于生態(tài)學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)、生物毒理學(xué)、群體遺傳學(xué)、生物地理學(xué)以及基因組學(xué)等學(xué)科的研究中。中國在世界上具有重要的生物地理學(xué)位置,但是該區(qū)域幾乎沒有象鼻溞的分類學(xué)、生物地理學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)以及群體遺傳學(xué)相關(guān)報(bào)道,故本論文旨在進(jìn)行中國大陸象鼻溞的分子系統(tǒng)學(xué)鑒定以及生物地理學(xué)的初步研究,進(jìn)而了解歷史因子和環(huán)境因子對象鼻溞的影響。得出以下結(jié)論:1、通過測定象鼻溞核基因ITS基因序列,對中國大陸地區(qū)35個(gè)水體內(nèi)的象鼻溞進(jìn)行分子系統(tǒng)學(xué)鑒定,揭示了中國象鼻溞的地理分布概況。本次調(diào)查檢測到兩個(gè)主要物種:一個(gè)是東亞地區(qū)特有的B.fatalis,另一個(gè)是在全北極廣泛分布的B.longirostris。除此以外,我們只在廣東省的一個(gè)水庫中發(fā)現(xiàn)了B.hagmanni.并且在青藏高原的10個(gè)水體中未發(fā)現(xiàn)象鼻溞的任何種類。2、進(jìn)一步研究分析兩個(gè)主要象鼻溞物種(即B.fatalis和B.longirostris)的16S基因堿基組成、序列變異情況、遺傳多樣性及遺傳分化分析;并通過分子鐘計(jì)算和種群歷史動態(tài)分析推測地質(zhì)歷史事件對象鼻溞不同物...
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1研究技術(shù)路線??Figure?1.1?Research?technology?route??..
2.3結(jié)果與分析??2.3.1?PCR產(chǎn)物檢測??凝膠電泳結(jié)果如圖2.1所示,最右側(cè)空白泳道為陰性對照;26號為陽性對照,其DNA??提取自大型潘M為Tiangan公司生產(chǎn)的D2000Marker。從圖中可以看到目的??片段擴(kuò)增條帶清晰明亮,且無非特異性擴(kuò)增條帶出現(xiàn)。??圖2.1?ITS基因PCR產(chǎn)物電泳圖??Figure?2.1?Electrophoregram?of?ITS?PCR?production??2.3.2?ITS單倍型檢測??本章研宄的35個(gè)群體中,在ITS基因位點(diǎn)共有305個(gè)個(gè)體測序成功獲得基因序列,??共檢測到12個(gè)單一單倍型,結(jié)果如附錄三。??2.3.3?ITS系統(tǒng)樹的構(gòu)建??基于ITS基因的系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹顯示長刺潘復(fù)合種主要有9個(gè)分支,分別對應(yīng)5.??longirostris、B.?liederi、B.fatalis、B.freyi、B.?hagmanni、B.?oriens、B.?coi-egoni、B.?longispnia??和5.加7〇如/,如圖2.2所示。中國35個(gè)水體中的象鼻潘只有5./〇嘆和??5.?Aagmawz/。在系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹上,中國地區(qū)的5.?與日本以及美洲地區(qū)的象鼻??潘潘親緣關(guān)系較近。5.沒有明顯的地域性分布,在泛北區(qū)各地均被發(fā)現(xiàn);而5.??/atote和5.?則有地域性分布
?1??o.oi??圖2.2基于ITS基因的ML系統(tǒng)樹??Figure?2.2?Phylogenetic?tree?of?ITS?gene?sequence?using?ML?algorithm??2.3.4?ITS單倍型網(wǎng)絡(luò)分析??單倍型網(wǎng)絡(luò)表明(圖2.3),具有兩個(gè)(/型和A型)出現(xiàn)頻率最高的單倍型。5.??為tote?(〇為?26?個(gè)水體共有(即?CAH,?DOH,?DTH,GYH,?HZH,?LMH,PYH,?QDH,STR,TAH,??XLH,?XFJR,?YIH,?HLH,?HSH,?CGH,?ELSR,?SHH,?AHR,?CSH,?DIC,?FXH,?HFH,?HLTR,?SCR,??and?YCH),?5.?(/〇為?17?個(gè)水體共有(即?CAH,?DPH,?LHR,?LUH,?PYH,?BSTH,HLH,??HSH,KDLH,LJXR,TIC,WLGH,ELSR,SHH,CSH,FXH,and?YCH)。其中,B.?/〇喂,>〇對咕??(/〇為一種頻繁共享的單倍型
本文編號:3566553
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1研究技術(shù)路線??Figure?1.1?Research?technology?route??..
2.3結(jié)果與分析??2.3.1?PCR產(chǎn)物檢測??凝膠電泳結(jié)果如圖2.1所示,最右側(cè)空白泳道為陰性對照;26號為陽性對照,其DNA??提取自大型潘M為Tiangan公司生產(chǎn)的D2000Marker。從圖中可以看到目的??片段擴(kuò)增條帶清晰明亮,且無非特異性擴(kuò)增條帶出現(xiàn)。??圖2.1?ITS基因PCR產(chǎn)物電泳圖??Figure?2.1?Electrophoregram?of?ITS?PCR?production??2.3.2?ITS單倍型檢測??本章研宄的35個(gè)群體中,在ITS基因位點(diǎn)共有305個(gè)個(gè)體測序成功獲得基因序列,??共檢測到12個(gè)單一單倍型,結(jié)果如附錄三。??2.3.3?ITS系統(tǒng)樹的構(gòu)建??基于ITS基因的系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹顯示長刺潘復(fù)合種主要有9個(gè)分支,分別對應(yīng)5.??longirostris、B.?liederi、B.fatalis、B.freyi、B.?hagmanni、B.?oriens、B.?coi-egoni、B.?longispnia??和5.加7〇如/,如圖2.2所示。中國35個(gè)水體中的象鼻潘只有5./〇嘆和??5.?Aagmawz/。在系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化樹上,中國地區(qū)的5.?與日本以及美洲地區(qū)的象鼻??潘潘親緣關(guān)系較近。5.沒有明顯的地域性分布,在泛北區(qū)各地均被發(fā)現(xiàn);而5.??/atote和5.?則有地域性分布
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本文編號:3566553
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