寬葉澤苔草（Caldesia grandis）為澤瀉科（Alismataceae）澤苔草屬（Caldesia）多年生挺水草本植物,主要分布于舊世界熱帶地區(qū),如馬來西亞、印度、中國等地的高山濕地、沼澤中。在中國,寬葉澤苔草在湖南、廣東、福建、浙江、云南及臺灣等地區(qū)都曾有過報(bào)道。近年來,由于人為干擾及生境的喪失,寬葉澤苔草的野外居群數(shù)量及規(guī)模已極大減少,該種已被IUCN列為“極度瀕�！敝参�。為給寬葉澤苔草制定科學(xué)的保護(hù)策略,本研究以中國現(xiàn)存9個(gè)寬葉澤苔草居群為研究對象,利用新開發(fā)的5對多態(tài)性葉綠體DNA片段序列及簡化基因組測序數(shù)據(jù),開展了自然居群的遺傳變異水平及譜系地理學(xué)等研究,主要結(jié)果如下:（1）開展了寬葉澤苔草三個(gè)個(gè)體的葉綠體全基因組測序與組裝,全長為168,211bp～168,304bp,通過比較發(fā)現(xiàn)三個(gè)葉綠體基因組的結(jié)構(gòu)、GC含量、基因數(shù)目及基因順序基本一致,且均未在IR區(qū)檢測到明顯的收縮或擴(kuò)張。并依據(jù)比較基因組學(xué)分析開發(fā)得到14個(gè)具多態(tài)性的葉綠體微衛(wèi)星位點(diǎn)（cpSSR）及28個(gè)葉綠體高突變位點(diǎn),并對其中10對引物進(jìn)行了PCR擴(kuò)增驗(yàn)證,得到了5對能穩(wěn)定擴(kuò)增的引物用于后續(xù)寬葉澤苔草的... 

【文章來源】：西藏大學(xué)西藏自治區(qū) 211工程院校

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

寬葉澤苔草植株及生境Figure2-1CommunitiesandhabitatsofC.grandis

21圖2-1寬葉澤苔草植株及生境Figure2-1CommunitiesandhabitatsofC.grandis圖注：（a）：拐湖居群生境；（b）：浪畔湖居群生境；（c）：臺灣宜蘭居群珠芽；（d）：青田居群植株；（e）：臨武居群植株。Note:(a):habitatsofGH;(b):habitatsofLPH;(c):inflorescencebulbilsinYL;(d):theindividualplantinQT;(e):theindividualplantinLW.圖2-2寬葉澤苔草9個(gè)居群的地理分布Figure2-2GeographicaldistributionoftheninepopulationsofC.grandis

313.2葉綠體全基因組組裝結(jié)果與結(jié)構(gòu)特征比較分析寬葉澤苔草三個(gè)葉綠體全基因組組裝結(jié)果顯示，其葉綠體基因組具有典型的環(huán)狀結(jié)構(gòu)，由大單拷貝區(qū)（LSC，Largesinglecopyregion）、小單拷貝區(qū)（SSC，Smallsinglecopyregion）和兩個(gè)反向重復(fù)區(qū)（IR，Invertedrepeatregion）組成。LPH居群全長為168,211bp，BH居群全長為168,309bp，NX居群全長為168,304bp；三個(gè)葉綠體基因組的大單拷貝區(qū)長度在90,985~90,989bp之間、小單拷貝區(qū)長度在13,679~13,680bp之間、反向重復(fù)區(qū)長度在31,771~31,830bp之間對葉綠體基因組注釋發(fā)現(xiàn)三個(gè)個(gè)體葉綠體基因組得到的基因個(gè)數(shù)均為113個(gè)，其中編碼蛋白的基因個(gè)數(shù)為79個(gè)，tRNA基因個(gè)數(shù)30，rRNA基因4個(gè)，有18個(gè)基因是位于IRs區(qū)，其中蛋白質(zhì)編碼基因7個(gè)，tRNA基因7個(gè)，rRNA基因4個(gè)，編碼區(qū)與非編碼區(qū)的比例大約為0.71，平均的基因密度約為0.78個(gè)基因/kb。且三個(gè)葉綠體基因組的GC含量均為37.1%，葉綠體基因組的詳細(xì)信息見表3-2。三個(gè)居群個(gè)體的葉綠體基因組環(huán)化物理圖，見圖3-1。圖3-1寬葉澤苔草3個(gè)居群葉綠體基因組的物理環(huán)化圖圖3-1CircularchloroplastgenomemapofCaldesiagrandis

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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