中國葫蘆科作物病毒的分布、多樣性及進化研究
【學(xué)位單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S432.41
【部分圖文】:
華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆博士研究生學(xué)位論文以色列病毒學(xué)家對以色列相鄰的以色列東部兩個地區(qū)的 2016 年果實進行時間和空間病毒組對比分析,同時進行去除核糖體 RNA-s分析結(jié)果利用 VirusDetect 病毒流程工具進行分析。結(jié)果表明兩個地不同病毒構(gòu)成。如果不考慮時間,毛型病毒屬的 CYSDV 只發(fā)生在 區(qū)。而菜豆金色花葉病毒屬的西瓜褪綠矮化病毒(Watermelon chlo2018 年在以色列東部地區(qū)發(fā)生但是在 K 城沒有檢測到。也觀察到時黃病毒2017年在K城發(fā)現(xiàn)但是2016年沒有檢測到。最重要的是毛型在以色列是新入侵的病毒,在所有檢測樣本發(fā)現(xiàn)。病毒的豐度與煙有關(guān)(Luria et al, 2019)。1.6 技術(shù)路線與研究目的和意義
圖 2-1 中國葫蘆科作物檢測樣本田間采樣圖Fig 2-1 field-grown cucurbit samples in china圓圈顏色和大小表現(xiàn)該區(qū)域的樣本大小Color and size of the circles indicate the sampling size表 2-5 疑似病毒病樣品田間采樣信息表Table 2-5 The information of suspected virus-infected samples collected from fiel省份Province區(qū)縣Courty地塊Field樣本數(shù)量Sample number采樣時Collec湖南 Hunan 1 1 1 2017.云南 Yunan 1 1 1 2017.廣西 Guangxi 4 9 64 2017.海南 Hainan 4 4 31 2017.河南 Henan 6 9 48 2017.新疆 Xinjiang 6 9 44 2017.重慶 Chongqing 4 7 41 2018.四川 Sichuan 2 4 31 2018.江西 Jiangxi 3 8 27 2018.
圖 2-2 采集樣本的寄主分布Fig2-2 The host distribution in collected cuc采集的 288 份 疑似病毒病樣品,盡量根據(jù)采集地塊一致的原則,進行混樣測序,混樣信息見附錄Ⅳ?偣矊y序,其中 sRNA-seq 106 份,rmRNA-seq 19 次份,測表 2-6 NGS 測序方法在不同采樣省Table 2-6 The distribution of NGS methods in differen省份 Province sRNA-seq rmRNA-seq廣西 Guangxi 22 0 海南 Hainan 6 6 河南 Henan 24 0 新疆 Xinjiang 5 13 重慶 Chongqing 19 0 江西 Jiangxi 13 0 四川 Sichuan 15 0 云南 Yunnan 1 0
【參考文獻】
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本文編號:2828734
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