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宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)快速鑒定兩種果樹負(fù)鏈RNA新病毒

發(fā)布時(shí)間:2024-02-04 01:11
  我國(guó)果樹資源豐富,蘋果、柑橘等水果含有豐富的維生素、多糖等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),具有抗氧化、抗衰老、抗炎癥等功效,具有重要的市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)價(jià)值。病毒病害影響果樹植株的正常生長(zhǎng),甚至給相關(guān)產(chǎn)業(yè)造成嚴(yán)重?fù)p失。果樹病毒病害種類較多,其中部分病害的病原物至今未能確認(rèn),因此果樹病毒病害的檢測(cè)與鑒定對(duì)于生產(chǎn)及防治至關(guān)重要。病毒在果樹體內(nèi)分布不均且具季節(jié)性差異,有些病毒為潛伏侵染,這些因素都限制了傳統(tǒng)病毒檢測(cè)方法在果樹病毒鑒定上的應(yīng)用。宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),可以在沒有任何同源性參考序列的情況下拼接出新病毒,它的發(fā)展大大加快了未知病毒病原物的檢測(cè)和鑒定進(jìn)程。宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序有兩種建庫(kù)方式:Poly(A)富集法和去除rRNA法。本研究首先使用Poly(A)富集法對(duì)癥狀表現(xiàn)為葉片卷曲、主脈黃化、矮化的長(zhǎng)春花樣品建庫(kù)測(cè)序獲得病毒片段,Blast比對(duì)鑒定其為中國(guó)未曾報(bào)道過的萵苣褪綠病毒(Lettuce chrolosis virus,LCV),利用RT-PCR技術(shù)驗(yàn)證基因組全序列。序列比對(duì)分析表明,本分離物L(fēng)CV-PW與加州分離物的全基因組RNA1和RNA2核苷酸序列相似度分別為85%和88%,11個(gè)ORFs氨基酸序列同源性為62%-...

【文章頁(yè)數(shù)】:91 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1.1蘋果扁枝病癥狀[10]

圖1.1蘋果扁枝病癥狀[10]

西南大學(xué)碩士學(xué)位論文做簡(jiǎn)要綜述。1.1.1蘋果腫枝/扁枝。ˋppleflatlimbdisease)也被稱為扭曲(Twisting)病[8],分布于世界各蘋果產(chǎn)區(qū),澳大利亞[8,9]、加拿大、丹麥、英國(guó)、意大利、挪威、瑞典、瑞士、阿拉伯地區(qū)、美國(guó)、南斯拉夫均有報(bào)道[1....


圖1.2蘋果膠木病癥狀[18]

圖1.2蘋果膠木病癥狀[18]

第1章文獻(xiàn)綜述易被果實(shí)壓彎(圖1.2B)。有研究發(fā)現(xiàn),感病的蘭蓬王在苗圃育苗期便可產(chǎn)果。顯微觀察發(fā)現(xiàn),患病樹體的木質(zhì)部導(dǎo)管細(xì)胞壁形態(tài)發(fā)生變化,枝條倒塌部位處的結(jié)構(gòu)與應(yīng)垃木凝膠纖維類似。目前沒有葉片、果實(shí)癥狀的相關(guān)報(bào)道。膠木病可侵染不同的蘋果品種,目前已報(bào)道的品種有蘭蓬王....


圖1.3柑橘鱗皮病癥狀[32,33]

圖1.3柑橘鱗皮病癥狀[32,33]

西南大學(xué)碩士學(xué)位論文葉斑(圖1.3C),并在葉片背面出現(xiàn)棕色粘性儂皰(圖1.3D),偶爾會(huì)導(dǎo)致果實(shí)表面出現(xiàn)環(huán)形凹陷斑(圖1.3E)[30]。CPsV具有寄主選擇性,感染甜橙、葡萄柚和寬皮柑橘后,會(huì)導(dǎo)致枝干的樹皮開裂[26],而酸檸檬、粗檸檬和酸橙等大部分柑橘品種往往....


圖1.4柑橘囊膠病的表現(xiàn)癥狀[32]

圖1.4柑橘囊膠病的表現(xiàn)癥狀[32]

圖1.4柑橘囊膠病的表現(xiàn)癥狀[32]:樹干凹陷(A)、枝干截面同心膠環(huán)(BC)和橡樹形葉片(D)Fig.1.4Concavitiesassociatedwithconcavegumdiseasesinthetrunkofasweetorangetr....



本文編號(hào):3894949

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