宏轉錄組學技術快速鑒定兩種果樹負鏈RNA新病毒
發(fā)布時間:2024-02-04 01:11
我國果樹資源豐富,蘋果、柑橘等水果含有豐富的維生素、多糖等營養(yǎng)物質,具有抗氧化、抗衰老、抗炎癥等功效,具有重要的市場經濟價值。病毒病害影響果樹植株的正常生長,甚至給相關產業(yè)造成嚴重損失。果樹病毒病害種類較多,其中部分病害的病原物至今未能確認,因此果樹病毒病害的檢測與鑒定對于生產及防治至關重要。病毒在果樹體內分布不均且具季節(jié)性差異,有些病毒為潛伏侵染,這些因素都限制了傳統(tǒng)病毒檢測方法在果樹病毒鑒定上的應用。宏轉錄組測序技術,可以在沒有任何同源性參考序列的情況下拼接出新病毒,它的發(fā)展大大加快了未知病毒病原物的檢測和鑒定進程。宏轉錄組測序有兩種建庫方式:Poly(A)富集法和去除rRNA法。本研究首先使用Poly(A)富集法對癥狀表現為葉片卷曲、主脈黃化、矮化的長春花樣品建庫測序獲得病毒片段,Blast比對鑒定其為中國未曾報道過的萵苣褪綠病毒(Lettuce chrolosis virus,LCV),利用RT-PCR技術驗證基因組全序列。序列比對分析表明,本分離物LCV-PW與加州分離物的全基因組RNA1和RNA2核苷酸序列相似度分別為85%和88%,11個ORFs氨基酸序列同源性為62%-...
【文章頁數】:91 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3894949
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圖1.1蘋果扁枝病癥狀[10]
西南大學碩士學位論文做簡要綜述。1.1.1蘋果腫枝/扁枝病(Appleflatlimbdisease)也被稱為扭曲(Twisting)病[8],分布于世界各蘋果產區(qū),澳大利亞[8,9]、加拿大、丹麥、英國、意大利、挪威、瑞典、瑞士、阿拉伯地區(qū)、美國、南斯拉夫均有報道[1....
圖1.2蘋果膠木病癥狀[18]
第1章文獻綜述易被果實壓彎(圖1.2B)。有研究發(fā)現,感病的蘭蓬王在苗圃育苗期便可產果。顯微觀察發(fā)現,患病樹體的木質部導管細胞壁形態(tài)發(fā)生變化,枝條倒塌部位處的結構與應垃木凝膠纖維類似。目前沒有葉片、果實癥狀的相關報道。膠木病可侵染不同的蘋果品種,目前已報道的品種有蘭蓬王....
圖1.3柑橘鱗皮病癥狀[32,33]
西南大學碩士學位論文葉斑(圖1.3C),并在葉片背面出現棕色粘性儂皰(圖1.3D),偶爾會導致果實表面出現環(huán)形凹陷斑(圖1.3E)[30]。CPsV具有寄主選擇性,感染甜橙、葡萄柚和寬皮柑橘后,會導致枝干的樹皮開裂[26],而酸檸檬、粗檸檬和酸橙等大部分柑橘品種往往....
圖1.4柑橘囊膠病的表現癥狀[32]
圖1.4柑橘囊膠病的表現癥狀[32]:樹干凹陷(A)、枝干截面同心膠環(huán)(BC)和橡樹形葉片(D)Fig.1.4Concavitiesassociatedwithconcavegumdiseasesinthetrunkofasweetorangetr....
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