甘蔗赤條病是由燕麥?zhǔn)乘峋帑渷喎NAcidovorax avenae subsp.avenae(Aaa)引起的甘蔗主要細(xì)菌性病害之一。為從轉(zhuǎn)錄組水平探討甘蔗應(yīng)答Aaa侵染的分子機(jī)制,本研究以抗赤條病新臺(tái)糖22號(hào)(ROC22)和感赤條病閩糖11-610(MT11-610)品種為實(shí)驗(yàn)材料。處理組用剪葉法接種Aaa菌液(SC-026),對(duì)照組接種無菌培養(yǎng)基,分別在接種0 h、24 h、48 h、72 h后采集甘蔗葉片(3次生物學(xué)重復(fù))。采用RNA-seq技術(shù)構(gòu)建甘蔗響應(yīng)Aaa侵染的轉(zhuǎn)錄組文庫,探尋甘蔗應(yīng)答Aaa侵染的差異表達(dá)基因(DEGs)及其代謝和信號(hào)通路,并對(duì)病程相關(guān)蛋白ScPR1基因進(jìn)行克隆和功能驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下:(1)從兩個(gè)品種中篩選出29,887個(gè)顯著DEGs,其中從抗病品種ROC22中獲得18,689個(gè)DEGs(45.5%的DEGs為上調(diào)表達(dá)),而從感病品種MT11-610中獲得15,782個(gè)差異基因(55.8%的DEGs為上調(diào)表達(dá))。KEGG富集分析顯示,共有3,818個(gè)DEGs富集在67條通路上,主要是苯丙烷生物合成途徑(ko00940)、光合作用天線蛋白途徑(ko001...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1兩個(gè)品種不同時(shí)間點(diǎn)的差異基因（DEGs）韋恩圖

3結(jié)果與分析24（R_AaavsR0_CK）中有18,689個(gè)，感病品種MT11-610處理組（S_AaavsS0_CK）中有15,782個(gè)。在ROC22處理組鑒定到的上下調(diào)DEGs分別有8,498和10,196個(gè)；MT11-610處理組中鑒定到的上下調(diào)DEGs分別有8,807和....

圖3-2抗病品種新臺(tái)糖22處理組差異基因GO功能注釋(A):上調(diào)差異基因；(B)：下調(diào)差異基因；BP:生物進(jìn)程；CC:分子組成；MF:分子功能Fig3-2.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)intheAaa-resistantcultivarROC22.Up-(A)anddownregulated(B)BP:biologicalprocess,CC:cellularcomponent,...

3結(jié)果與分析26圖3-2抗病品種新臺(tái)糖22處理組差異基因GO功能注釋(A):上調(diào)差異基因；(B)：下調(diào)差異基因；BP:生物進(jìn)程；CC:分子組成；MF:分子功能Fig3-2.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgen....

圖3-3感病品種閩糖11-610處理組差異基因GO功能注釋(A):上調(diào)差異基因；(B)：下調(diào)差異基因；BP:生物進(jìn)程；CC:分子組成；MF:分子功能Fig3-3.GeneOntology(GO)annotationofdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)intheAaa-susceptiblecultivarMT11-610.Up-(A)anddownregulated(B).BP:biologicalprocess,CC:cellularc...

甘蔗響應(yīng)赤條病菌侵染的ScPR1基因的鑒定與功能分析27最多的是催化活性，2,641個(gè)，其次是作用于糖基鍵的水解酶活性，有211個(gè)DEGs。圖3-3感病品種閩糖11-610處理組差異基因GO功能注釋(A):上調(diào)差異基因；(B)：下調(diào)差異基因；BP:生物進(jìn)程；CC:分子組成；MF:....

圖3-4基于qRT-PCR驗(yàn)證12個(gè)差異基因相對(duì)表達(dá)量（2ΔΔCT）熱圖

3結(jié)果與分析30圖3-4基于qRT-PCR驗(yàn)證12個(gè)差異基因相對(duì)表達(dá)量（2ΔΔCT）熱圖注：星號(hào)表示每個(gè)時(shí)間點(diǎn)相對(duì)表達(dá)水平的顯著性差異（*表示p<0.05;**表示p<0.01）;紅色表示上調(diào)表達(dá)，藍(lán)色表示下調(diào)表達(dá)。Fig3-4.Heatmapdepictingrelativee....

本文編號(hào)：3894992