辣椒是一種重要的蔬菜,山東省是我國重要的辣椒產(chǎn)區(qū)之一。近年來,辣椒種植面積逐年增加,病毒病發(fā)生日益嚴重,辣椒產(chǎn)量和品質(zhì)均受到影響,造成重大的經(jīng)濟損失,制約辣椒產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。為了進一步明確侵染山東省辣(甜)椒的病毒種類以及病毒的發(fā)生分布情況,本研究運用分子生物學方法,利用14種病毒的特異性引物對采自山東省濟寧、濰坊、聊城、泰安、煙臺、德州和淄博等7個地區(qū)的542份辣(甜)椒樣品進行病毒的檢測與鑒定,并對甜菜西方黃化病毒(Beet western yellows virus,BWYV)和南瓜蚜傳黃化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)的全基因組序列進行克隆測序及分析。分別將這兩種病毒的全基因組序列與相應的病毒序列進行比對,并分別對其全基因組核苷酸序列進行了相似性分析和系統(tǒng)進化分析,利用RDP 4軟件對BWYV和CABYV分離物進行RNA重組分析。主要研究結(jié)果如下:1.2016-2017年,對542份辣(甜)椒樣品進行14種病毒檢測,共檢測出5種病毒,分別是BWYV、CABYV、辣椒脈黃化病毒(Pepper vein yellows virus,PeVYV)、辣椒潛隱病毒1(Pepper cryptic virus 1,PCV-1)和辣椒潛隱病毒2(Pepper cryptic virus 2,PCV-2)。其中甜瓜蚜傳黃化病毒(Melon aphid-borne yellows virus,MABYV)、番茄斑萎病毒(Tomato spot wilt virus,TSWV)、南方番茄病毒(Southern tomato virus,STV)、辣椒環(huán)斑病毒(Chilli ring spot virus,ChiRSV)、番茄斑駁花葉病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)、葫蘆蚜傳黃化病毒(Pepo aphid-borne yellows virus,PABYV)、絲瓜蚜傳黃化病毒(Suakwa aphid-borne yellows virus,SABYV)、花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)和番茄壞死矮化病毒(Tomato necrotic stunt virus,ToNStV)未檢測到。2016-2017年,病毒檢出率為63.65%,其中2016年病毒檢出率為64.18%,2017年病毒檢出率為60.92%。在檢出的病毒中,PCV-1病毒檢出率最高,達32.84%,其次是PCV-2、BWYV和PeVYV,檢出率分別是31.73%、31.32%、7.75%,CABYV檢出率最低為0.37%。2.在檢測的542份樣品中,存在病毒的復合侵染現(xiàn)象,病毒的復合侵染率為31.30%。主要存在2種和3種病毒的復合侵染類型,其中以2種病毒的復合侵染類型為主,復合侵染率為92.59%,3種病毒復合侵染率為7.41%。3.分別從濟寧和濰坊兩地在2016年和2017年采集的感染BWYV的辣椒樣品中各選取一個進行BWYV全基因組序列擴增,得到4條BWYV的全基因組序列,長為5693-5699 bp。對CABYV進行全基因組序列擴增,結(jié)果顯示CABYV的全基因組序列長為5684 bp。4.分別對BWYV和CABYV的全基因組核苷酸序列進行相似性分析和系統(tǒng)進化樹分析,結(jié)果表明:4個BWYV山東分離物聚類在一個分支上,與中國和韓國分離物聚類在一個分支上,親緣關(guān)系較近。BWYV在進化上可能與地理位置有關(guān),與寄主無明顯關(guān)系。CABYV-LJ3與中國、韓國和日本分離物聚類在一個分支上,親緣關(guān)系較近,該病毒在進化上可能與地理位置有關(guān),與寄主無關(guān)。分別對BWYV和CABYV進行重組分析,結(jié)果表明:BWYV-JN16311與BWYV-WF1793分離物之間存在重組現(xiàn)象。CABYV-LJ3分離物與中國分離物(GQ221223)存在重組現(xiàn)象,與中國分離物(HQ439023)存在潛在重組。
【學位單位】：山東農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：S432.41
【部分圖文】：

圖 1-3 CABYV 侵染瓜類作物的癥狀（Suveditha et al., 2017）Fig. 1-3 The symptoms of CABYV in melon crops (Suveditha et al., 2017).1.1.3 辣椒脈黃化病毒

圖 1-4 PeVYV 基因組結(jié)構(gòu)（Regenmortel et al., 2000）Fig. 1-4 Genomic structure of PeVYV (Regenmortel et al., 2000)

圖 1-5 PeVYV 侵染辣椒的癥狀（Tomassoli et al., 2016）Fig. 1-5 The symptoms of PeVYV in pepper (Tomassoli et al., 2016)屬
【參考文獻】

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本文編號：2892774