西瓜是世界上重要的水果作物之一,而病毒病害的普遍發(fā)生嚴(yán)重影響其產(chǎn)量和品質(zhì),目前國內(nèi)外有關(guān)西瓜新病毒的研究比較少。本研究對(duì)2015-2016年間采自于河南省開封市瓜田呈現(xiàn)典型病毒病癥狀的標(biāo)樣進(jìn)行高通量測(cè)序,通過序列拼接和比對(duì)共鑒定出8種西瓜病毒,分別為5種已知病毒:西瓜花葉病毒（Watermelon mosaic virus,WMV）,小西葫蘆黃花葉病毒（Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV）,甜瓜蚜傳黃化病毒（Melon aphid-borne yellows virus,MABYV）黃瓜綠斑駁花葉病毒（Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV）以及1種國內(nèi)未報(bào)道過的西瓜隱潛病毒（Citrullus lanatus cryptic virus,CiLCV）;3種未知RNA病毒,分別暫命名為:西瓜皺葉病毒1號(hào)（Watermelon crinkle leaf virus 1,WCLV-1）,西瓜皺葉病毒2號(hào)（Watermelon crinkle leaf virus2,WCLV-2）和西瓜病毒A（Watermelon v... 

【文章頁數(shù)】：74 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
英文縮略表
第一章 引言
    1.1 植物病毒鑒定方法研究進(jìn)展
        1.1.1 生物學(xué)檢測(cè)法
        1.1.2 血清學(xué)方法
        1.1.3 電子顯微鏡檢測(cè)法
        1.1.4 分子生物學(xué)方法
        1.1.5 高通量測(cè)序技術(shù)
    1.2 西瓜病毒病害研究進(jìn)展
    1.3 研究目的和意義
    1.4 技術(shù)路線
第二章 西瓜標(biāo)樣的RNA-seq和sRNA-seq分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 樣品采集
        2.1.2 試劑與儀器
        2.1.3 TRIzol法提取西瓜樣品中的總RNA
        2.1.4 小RNA測(cè)序及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
        2.1.5 原始數(shù)據(jù)處理與分析
        2.1.6 RT-PCR檢測(cè)及驗(yàn)證
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 高通量測(cè)序結(jié)果分析
        2.2.2 候選病原物的確定及RT-PCR驗(yàn)證
    2.3 小結(jié)與討論
第三章 西瓜新病毒的分子鑒定及生物學(xué)研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 樣品準(zhǔn)備
        3.1.2 試劑及溶液配制
        3.1.3 儀器
        3.1.4 西瓜樣品總RNA提取
        3.1.5 dsRNA提取
        3.1.6 RACE擴(kuò)增全基因組
        3.1.7 病毒粒體形態(tài)觀察
        3.1.8 生物學(xué)測(cè)定
        3.1.9 生物信息學(xué)分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 小RNA測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序鑒定2種未知的西瓜負(fù)單鏈RNA病毒
        3.2.2 小RNA測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序鑒定西瓜病毒A（WVA）
        3.2.3 小RNA測(cè)序鑒定西瓜隱潛病毒（CiLCV）
        3.2.4 田間樣品多種病毒復(fù)合侵染分析
    3.3 小結(jié)與討論
第四章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡歷



本文編號(hào)：3663641