大麥黃矮病毒（barley yellow dwarf viruses, BYDVs）引起的小麥黃矮病嚴(yán)重威脅我國麥類生產(chǎn),造成嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失。植物中的miRNA調(diào)控植物生長發(fā)育、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及對外界壓力的反應(yīng),通過調(diào)控植物抗性基因的表達(dá)影響植物與病原物的互作。本研究對感染BYDV-GAV后3 d、7 d及健康對照的‘小偃6號(hào)’小麥樣品進(jìn)行miRNA測序,合并去冗余后分別得到99、96、95個(gè)已知的miRNA序列和806、809、1 024個(gè)新miRNA序列。對這些miRNA進(jìn)行差異表達(dá)分析,BYDV-GAV侵染后3 d和7 d的小麥樣品,與對照相比上調(diào)表達(dá)的miRNA數(shù)量分別為3個(gè)和7個(gè),下調(diào)表達(dá)的為14個(gè)和12個(gè)。將差異表達(dá)的miRNA利用psRNATarget進(jìn)行靶基因預(yù)測,共得到1 254個(gè)靶標(biāo)基因。靶基因的KEGG和GO富集分析,進(jìn)一步明確了其功能及作用通路。對14個(gè)病毒病癥狀相關(guān)的靶基因進(jìn)行定量分析,結(jié)果表明隨病毒侵染時(shí)間的延長,這些靶基因出現(xiàn)差異性表達(dá),顯示miRNA參與了寄主與病毒的互作。研究結(jié)果有助于揭示BYDV-GAV與寄主小麥的互作機(jī)理。 

【文章來源】：植物病理學(xué)報(bào). 2020,50(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 miRNA測序樣品準(zhǔn)備
        1.2.2 RNA提取及miRNA測序
        1.2.3 miRNA注釋及新miRNA預(yù)測
        1.2.4 miRNA差異表達(dá)分析
        1.2.5 差異表達(dá)miRNA靶基因預(yù)測及富集分析
        1.2.6 差異表達(dá)miRNA的qRT-PCR驗(yàn)證及靶基因表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 miRNA測序結(jié)果
        2.1.1 miRNA測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
        2.1.2 miRNA的長度分布及堿基偏好性
        2.1.3 miRNA注釋與新miRNA預(yù)測
        2.1.4 差異表達(dá)miRNA
        2.1.5 差異表達(dá)miRNA靶基因預(yù)測
        2.1.6 靶基因GO富集分析
        2.1.7 靶基因KEGG通路分析
    2.2 差異表達(dá)miRNA的RT-qPCR驗(yàn)證
    2.3 靶基因定量檢測結(jié)果
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本文編號(hào)：3350755