不同水稻品系對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
發(fā)布時(shí)間:2021-08-18 23:04
稻縱卷葉螟(Cnaphaalocrocis medinalisGuenee)(Rice leaf folder,RLF)是一種世界范圍內(nèi)危害水稻、大麥、小麥、甘蔗等作物的重要害蟲(chóng)。腸道微生物在宿主的食物消化、生長(zhǎng)發(fā)育、免疫以及代謝方面起著重要的作用,近年來(lái)新一代測(cè)序技術(shù)大大推動(dòng)了腸道微生物的研究。為分析稻縱卷葉螟腸道微生物對(duì)宿主的功能,本文綜合運(yùn)用傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)技術(shù)、變性梯度凝膠電泳技術(shù)(DGGE)、16SrRNA基因測(cè)序技術(shù)以及宏基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性及其功能進(jìn)行了分析,具體結(jié)果如下:一、取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能采用傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)方法,共分離得到10種不同的細(xì)菌,其中變形菌門(mén)Proteobacteria和厚壁菌門(mén)Firmicutes所占比例分別為70%和30%,表明變形菌門(mén)為稻縱卷葉螟腸道可培養(yǎng)細(xì)菌中的優(yōu)勢(shì)菌群。采用DGGE方法,分離得到的變形菌門(mén)所占比例為77%,厚壁菌門(mén)所占比例為23%,在門(mén)的水平上腸道微生物的組成與傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)方法一致。利用16SrRNA基因測(cè)序技術(shù)分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌組成,結(jié)果表明,稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌主要由變形菌門(mén)...
【文章來(lái)源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 稻縱卷葉螟的生物學(xué)特征、危害及防治
1.2 昆蟲(chóng)腸道微生物的研究概況
1.3 昆蟲(chóng)腸道微生物的研究意義
1.4 昆蟲(chóng)腸道微生物的功能
1.4.1 腸道微生物消化食物與提供營(yíng)養(yǎng)的功能
1.4.2 腸道微生物對(duì)昆蟲(chóng)的保護(hù)防御功能
1.4.3 腸道微生物與Bt抗性的關(guān)系
1.4.4 腸道微生物的其他功能
1.5 昆蟲(chóng)腸道微生物的研究方法
1.6 本研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 主要儀器及試劑配置
2.1.1 主要儀器
2.1.2 主要試劑
2.1.3 培養(yǎng)基配制
2.1.4 DGGE試劑配制
2.1.5 引物設(shè)計(jì)與合成
2.2 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的研究
2.2.1 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的分離與培養(yǎng)
2.2.2 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的PCR-DGGE分析
2.2.3 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌16S rRNA基因V4高變區(qū)測(cè)序
2.2.4 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌宏基因組測(cè)序與分析
2.2.5 宏基因組測(cè)序分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的功能
2.3 取食不同品系水稻稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異的研究
2.3.1 供試蟲(chóng)源與食源
2.3.2 PCR-DGGE分析不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
2.3.3 16S rRNA基因測(cè)序分析不同品系水稻稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
2.4 Bt水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)影響的研究
2.4.1 稻縱卷葉螟的飼養(yǎng)
2.4.2 16S rRNA基因測(cè)序分析轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
3 結(jié)果與分析
3.1 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的分析
3.1.1 傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)法分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性
3.1.2 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌DGGE分析
3.1.3 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌16S rRNA基因V4高變區(qū)測(cè)序分析
3.1.4 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌宏基因組分析
3.1.5 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌功能研究
3.2 不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.2.1 DGGE法分析不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.2.2 16S rRNA基因測(cè)序分析不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.3 轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.3.1 基于門(mén)水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.2 基于綱水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.3 基于目水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.4 基于科水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.5 基于屬水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.6 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌LEfSe分析
4 總結(jié)與討論
4.1 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的研究
4.2 不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
4.3 轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
參考文獻(xiàn)
附錄1
附錄2
附錄3
致謝
本文編號(hào):3350793
【文章來(lái)源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 稻縱卷葉螟的生物學(xué)特征、危害及防治
1.2 昆蟲(chóng)腸道微生物的研究概況
1.3 昆蟲(chóng)腸道微生物的研究意義
1.4 昆蟲(chóng)腸道微生物的功能
1.4.1 腸道微生物消化食物與提供營(yíng)養(yǎng)的功能
1.4.2 腸道微生物對(duì)昆蟲(chóng)的保護(hù)防御功能
1.4.3 腸道微生物與Bt抗性的關(guān)系
1.4.4 腸道微生物的其他功能
1.5 昆蟲(chóng)腸道微生物的研究方法
1.6 本研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 主要儀器及試劑配置
2.1.1 主要儀器
2.1.2 主要試劑
2.1.3 培養(yǎng)基配制
2.1.4 DGGE試劑配制
2.1.5 引物設(shè)計(jì)與合成
2.2 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的研究
2.2.1 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的分離與培養(yǎng)
2.2.2 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的PCR-DGGE分析
2.2.3 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌16S rRNA基因V4高變區(qū)測(cè)序
2.2.4 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌宏基因組測(cè)序與分析
2.2.5 宏基因組測(cè)序分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的功能
2.3 取食不同品系水稻稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異的研究
2.3.1 供試蟲(chóng)源與食源
2.3.2 PCR-DGGE分析不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
2.3.3 16S rRNA基因測(cè)序分析不同品系水稻稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
2.4 Bt水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)影響的研究
2.4.1 稻縱卷葉螟的飼養(yǎng)
2.4.2 16S rRNA基因測(cè)序分析轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌的影響
3 結(jié)果與分析
3.1 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的分析
3.1.1 傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)法分析稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌多樣性
3.1.2 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌DGGE分析
3.1.3 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌16S rRNA基因V4高變區(qū)測(cè)序分析
3.1.4 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌宏基因組分析
3.1.5 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌功能研究
3.2 不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.2.1 DGGE法分析不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.2.2 16S rRNA基因測(cè)序分析不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.3 轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
3.3.1 基于門(mén)水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.2 基于綱水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.3 基于目水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.4 基于科水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.5 基于屬水平分析腸道細(xì)菌群落分布
3.3.6 稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌LEfSe分析
4 總結(jié)與討論
4.1 取食甬優(yōu)15品系稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和功能的研究
4.2 不同品系水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
4.3 轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)稻縱卷葉螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響
參考文獻(xiàn)
附錄1
附錄2
附錄3
致謝
本文編號(hào):3350793
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