PdtWRKY86在雜交楊銹菌互作中的功能
發(fā)布時(shí)間:2020-06-03 23:27
【摘要】:楊樹是世界上適應(yīng)性最強(qiáng)、分布最廣的樹種。隨著楊樹人工林面積的不斷擴(kuò)大,我國現(xiàn)擁有世界上面積最大的楊樹人工林。楊樹是一個(gè)易發(fā)生病蟲害的樹種,其中危害楊樹的致病菌株有300多種,我國報(bào)道存在的有110多種。在楊樹葉部病害中,落葉松-楊柵銹菌(Melampsora larici-populina)引起的楊樹葉銹病分布最廣、危害最大。通過落葉松楊柵銹菌E4強(qiáng)致病株系接種后兩個(gè)楊樹品種的癥狀及其間苯三酚染色判定雜交楊與E4銹菌互作為非親和型互作,歐美雜交楊與E4銹菌互作為親和型互作。以雜交楊為主要研究對(duì)象,歐美雜交楊作對(duì)照,對(duì)E4銹菌侵染后96 h兩個(gè)品種轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄因子參與雜交楊應(yīng)答E4銹菌侵染,其中NAC、WRKY、MYB、AP2和ERF所占比例較大。進(jìn)一步對(duì)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中重要的5個(gè)轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),大部分WRKY轉(zhuǎn)錄因子在雜交楊應(yīng)答E4銹菌12 h和96 h上調(diào)表達(dá),起正向調(diào)控作用。WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族屬于調(diào)控蛋白家族,是植物防御信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中至關(guān)重要的因子。以雜交楊轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),鑒定到100個(gè)PdtWRKY基因,其中99個(gè)PdtWRKY基因分別對(duì)應(yīng)在毛果楊19條染色體上,PdtWRKY100定位于Scaffold_41。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析表明雜交楊接種E4銹菌后有53個(gè)基因差異表達(dá)(8個(gè)基因下調(diào),45個(gè)基因上調(diào)),選擇上調(diào)表達(dá)的基因進(jìn)行進(jìn)一步研究。對(duì)45個(gè)基因進(jìn)行靶基因預(yù)測,其中有28個(gè)基因找到相應(yīng)的靶基因,共有305個(gè)靶基因,建立調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。對(duì)靶基因進(jìn)行分類整理后,發(fā)現(xiàn)其中有21個(gè)靶基因具有轉(zhuǎn)錄因子活性,其中包括PdtWRKY64,它的上游基因?yàn)镻dtWRKY86。PdtWRKY86在雜交楊接種E4銹菌后上調(diào)表達(dá),轉(zhuǎn)錄調(diào)控唯一的靶基因PdtWRKY64,PdtWRKY64又轉(zhuǎn)錄調(diào)控18個(gè)基因,其中12個(gè)與植物抗病相關(guān)。由此表明PdtWRKY86具有多級(jí)調(diào)控網(wǎng)絡(luò),它的靶基因在雜交楊接種E4銹菌后也上調(diào)表達(dá),因此篩選出PdtWRKY86基因作為研究對(duì)象。為明確PdtWRKY86基因在雜交楊與E4銹菌互作過程中的功能,克隆該基因、對(duì)7個(gè)時(shí)間點(diǎn)表達(dá)量進(jìn)行分析并進(jìn)行轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證。PdtWRKY86CDS全長為965 bp,編碼311個(gè)氨基酸。除6 h外其余6個(gè)時(shí)間點(diǎn)均上調(diào)表達(dá),表明PdtWRKY86在雜交楊與E4銹菌非親和互作過程中起到正向調(diào)控作用。PdtWRKY86轉(zhuǎn)基因擬南芥陽性植株較野生型擬南芥接種灰葡萄孢和致病疫霉后發(fā)病慢、病斑小,PdtWRKY86轉(zhuǎn)基因擬南芥較野生型擬南芥抗病性強(qiáng),表明PdtWRKY86轉(zhuǎn)基因植物通過多級(jí)調(diào)控抗病相關(guān)基因的表達(dá),提高轉(zhuǎn)基因植物的抗病性。綜上所述,證明PdtWRKY86是雜交楊-E4銹菌非親和型互作過程的正向調(diào)控因子。
【圖文】:
E4銹菌接種歐美雜交楊葉片后2邋h銹菌孢子萌發(fā),到24邋h葉片未發(fā)生明顯癥狀,逡逑48邋h葉片出現(xiàn)褪綠小斑點(diǎn),%邋h葉背出現(xiàn)明顯的黃色斑點(diǎn)并逐漸擴(kuò)大,至168邋h葉背形逡逑成多個(gè)夏孢子堆(圖2-1),此時(shí)E4銹菌完成夏孢子的生活史,判定歐美雜交楊為E4逡逑銹菌的親和型品種。E4銹菌接種雜交楊葉片后2邋h銹菌孢子也萌發(fā),至48邋h葉片均未逡逑觀察到明顯癥狀,96邋h葉背出現(xiàn)褪綠點(diǎn)斑并逐漸擴(kuò)大,顏色變深,至168邋h時(shí)葉背組織逡逑出現(xiàn)多處壞死斑點(diǎn)并產(chǎn)生少數(shù)夏孢子堆(圖2-1),判定雜交楊為E4銹菌的非親和型品逡逑種。逡逑CK邋2h邋6h邋12邋h邋24邋h邋48邋h邋96邋h邋168邋h逡逑■■■■■■逡逑圖2-1邋E4銹菌接種楊樹葉片癥狀逡逑Figure邋2-1邋Infestation邋of邋poplar邋leaves邋with邋E4邋rust逡逑接種后的葉片經(jīng)過間苯三酚染色,葉片被染紅部分則為木質(zhì)素的積累。在歐美雜交逡逑楊接種葉片上發(fā)現(xiàn),在2邋h到24邋h葉片透明部分沒有明顯癥狀,葉脈呈紅色,48邋h葉片逡逑透明部分有深色斑點(diǎn),逐漸擴(kuò)大,96邋h葉片透明部分斑點(diǎn)增大,至168邋h透明部分可以逡逑看到多個(gè)夏孢子堆,夏孢子堆呈棕色(圖2-2)。根據(jù)Ce'cile邋Rinaldi等人研究表明木質(zhì)逡逑素在非親和型互作過程中銹菌侵染部位沉積較多191。歐美雜交楊葉片168邋h木質(zhì)素積累逡逑較少
逑96邋h葉片透明部分有暗棕色小斑點(diǎn),斑點(diǎn)逐漸擴(kuò)大,至168邋h時(shí)葉片透明部分可以看到逡逑大塊黃色壞死斑點(diǎn)和少數(shù)夏孢子堆(圖2-2)。雜交楊葉片168邋h木質(zhì)素積累較多,葉片逡逑整個(gè)染為紅色,進(jìn)一步判定雜交楊與E4銹菌互作為非親和型互作(incompatible逡逑interactions邋)0逡逑CK邐2h邐6邋h邐12邋h邋24邋h邋48邋h邋96邋h邋168邋h逡逑-邋;邋r邋;邋v邋\:r逡逑一逡逑圖2-2間苯三酚染色逡逑Figure邋2-2邋Pyrogallol邋staining逡逑2.2.2接種E4銹菌后表達(dá)差異的楊樹基因及GO富集分析逡逑經(jīng)過對(duì)96邋h兩個(gè)楊樹品種的CK組和接種組轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,在接種E4銹菌后其逡逑表達(dá)量log2(rust+/CK)有差異,,并且差異極顯著(綜合數(shù)據(jù)中用x2邋(/^0.01)確定)的楊逡逑樹基因共有1,228個(gè)。逡逑GO富集分析對(duì)1,邋228個(gè)基因進(jìn)行注釋。與所有的差異表達(dá)的楊樹基因相比,其中逡逑281個(gè)基因顯著富集與DNA依賴轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)(GO:邋0006355,邋p邋=邋1.0e-07,邋FDR邋=逡逑1.60e-05)。進(jìn)一步富集281個(gè)基因后,與轉(zhuǎn)錄因子活性相關(guān)的138個(gè)基因(GO:逡逑0003700
【學(xué)位授予單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S763.7
本文編號(hào):2695560
【圖文】:
E4銹菌接種歐美雜交楊葉片后2邋h銹菌孢子萌發(fā),到24邋h葉片未發(fā)生明顯癥狀,逡逑48邋h葉片出現(xiàn)褪綠小斑點(diǎn),%邋h葉背出現(xiàn)明顯的黃色斑點(diǎn)并逐漸擴(kuò)大,至168邋h葉背形逡逑成多個(gè)夏孢子堆(圖2-1),此時(shí)E4銹菌完成夏孢子的生活史,判定歐美雜交楊為E4逡逑銹菌的親和型品種。E4銹菌接種雜交楊葉片后2邋h銹菌孢子也萌發(fā),至48邋h葉片均未逡逑觀察到明顯癥狀,96邋h葉背出現(xiàn)褪綠點(diǎn)斑并逐漸擴(kuò)大,顏色變深,至168邋h時(shí)葉背組織逡逑出現(xiàn)多處壞死斑點(diǎn)并產(chǎn)生少數(shù)夏孢子堆(圖2-1),判定雜交楊為E4銹菌的非親和型品逡逑種。逡逑CK邋2h邋6h邋12邋h邋24邋h邋48邋h邋96邋h邋168邋h逡逑■■■■■■逡逑圖2-1邋E4銹菌接種楊樹葉片癥狀逡逑Figure邋2-1邋Infestation邋of邋poplar邋leaves邋with邋E4邋rust逡逑接種后的葉片經(jīng)過間苯三酚染色,葉片被染紅部分則為木質(zhì)素的積累。在歐美雜交逡逑楊接種葉片上發(fā)現(xiàn),在2邋h到24邋h葉片透明部分沒有明顯癥狀,葉脈呈紅色,48邋h葉片逡逑透明部分有深色斑點(diǎn),逐漸擴(kuò)大,96邋h葉片透明部分斑點(diǎn)增大,至168邋h透明部分可以逡逑看到多個(gè)夏孢子堆,夏孢子堆呈棕色(圖2-2)。根據(jù)Ce'cile邋Rinaldi等人研究表明木質(zhì)逡逑素在非親和型互作過程中銹菌侵染部位沉積較多191。歐美雜交楊葉片168邋h木質(zhì)素積累逡逑較少
逑96邋h葉片透明部分有暗棕色小斑點(diǎn),斑點(diǎn)逐漸擴(kuò)大,至168邋h時(shí)葉片透明部分可以看到逡逑大塊黃色壞死斑點(diǎn)和少數(shù)夏孢子堆(圖2-2)。雜交楊葉片168邋h木質(zhì)素積累較多,葉片逡逑整個(gè)染為紅色,進(jìn)一步判定雜交楊與E4銹菌互作為非親和型互作(incompatible逡逑interactions邋)0逡逑CK邐2h邐6邋h邐12邋h邋24邋h邋48邋h邋96邋h邋168邋h逡逑-邋;邋r邋;邋v邋\:r逡逑一逡逑圖2-2間苯三酚染色逡逑Figure邋2-2邋Pyrogallol邋staining逡逑2.2.2接種E4銹菌后表達(dá)差異的楊樹基因及GO富集分析逡逑經(jīng)過對(duì)96邋h兩個(gè)楊樹品種的CK組和接種組轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,在接種E4銹菌后其逡逑表達(dá)量log2(rust+/CK)有差異,,并且差異極顯著(綜合數(shù)據(jù)中用x2邋(/^0.01)確定)的楊逡逑樹基因共有1,228個(gè)。逡逑GO富集分析對(duì)1,邋228個(gè)基因進(jìn)行注釋。與所有的差異表達(dá)的楊樹基因相比,其中逡逑281個(gè)基因顯著富集與DNA依賴轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)(GO:邋0006355,邋p邋=邋1.0e-07,邋FDR邋=逡逑1.60e-05)。進(jìn)一步富集281個(gè)基因后,與轉(zhuǎn)錄因子活性相關(guān)的138個(gè)基因(GO:逡逑0003700
【學(xué)位授予單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S763.7
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2695560
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