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復雜網絡中關鍵節(jié)點查找和鏈路預測應用研究

發(fā)布時間:2020-06-15 17:15
【摘要】:隨著網絡科學的不斷發(fā)展和信息數據的不斷擴充,網絡規(guī)模日益增大,大規(guī)模網絡數據的研究也逐漸成為研究熱潮。鑒于表示學習算法對大規(guī)模網絡研究的優(yōu)勢,關鍵節(jié)點分類以及鏈路預測等基于網絡知識的傳統(tǒng)研究內容開始結合知識表示學習算法進行探索研究,并取得顯著成果。本文結合網絡科學知識和表示學習算法提出關鍵蛋白質分類和基于Probase知識庫的鏈路預測兩種算法框架。首先,本文提出了一種結合生物信息知識的關鍵蛋白質分類的方法。在關鍵節(jié)點搜索的相關研究中,很多實驗已經證明結合多源信息的方法比僅考慮單一知識的方法更加有效。而現有的搜索方法并沒有充分的考慮網絡本身蘊含的知識,使得很多關鍵信息被丟失。本文提出的關鍵蛋白質分類方法則是結合STRING數據庫中體現的PPI網絡中蛋白質節(jié)點的生物信息,同時結合表示學習算法提取網絡中蛋白質節(jié)點的拓撲結構特征和生物信息特征,實現關鍵蛋白質節(jié)點的分類。通過實驗對比分析,本文提出的關鍵蛋白質分類算法的準確率、召回率及F_1值均高于其對比實驗,這表明表示學習算法在網絡關鍵節(jié)點識別任務中具有一定的優(yōu)勢。其次,本文提出了基于Probase知識庫的鏈路預測方法。鏈路預測即通過分析網絡結構以及節(jié)點屬性,探索網絡中相似的節(jié)點,進一步預測與已知節(jié)點具有潛在連邊的節(jié)點。本文提出的鏈路預測方法主要結合網絡嵌入的表示學習算法將網絡進行向量化表示,并基于相似度的計算方法確定節(jié)點之間的相似程度,實現網絡的鏈路預測。通過統(tǒng)計預測結果的top-k命中率、計算預測節(jié)點與給定節(jié)點的相似性和統(tǒng)計最短路徑長度來驗證算法的有效性和穩(wěn)定性,從而證明表示學習算法對鏈路預測任務有很好的提升作用。綜上,本文利用多源信息并結合表示學習算法可以有效的提升網絡中關鍵蛋白質節(jié)點分類的準確率。同時利用表示學習算法將網絡進行向量化表示,借助相似度計算方法來計算節(jié)點的相似性,完成鏈路預測,可以提高預測的命中率,保證預測的穩(wěn)定性。
【學位授予單位】:大連理工大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:O157.5

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本文編號:2714743

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