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細胞重編程調(diào)控網(wǎng)絡的非線性隨機動力學研究

發(fā)布時間:2020-05-05 01:30
【摘要】:細胞重編程技術對藥物發(fā)現(xiàn)及篩選、移植治療、基因治療和疾病研究帶來了深遠影響,同時也打開了再生醫(yī)學的大門。然而,大量實驗研究表明,細胞重編程過程會面臨效率低、不完整等問題。因此,如何提高重編程的效率及加速重編程過程的生物技術成為前沿課題之一。本文以體細胞重編程過程實驗為基礎,根據(jù)細胞重編程過程中基因表達的時間線(Timeline),構建起重編程過程中標記基因之間前反饋調(diào)控網(wǎng)絡模型,利用隨機動力學理論和數(shù)值模擬方法對該模型進行動力學研究,得到了以下研究成果:(1)根據(jù)重編程過程中標記基因之間前反饋調(diào)控網(wǎng)絡模型,建立起了重編程過程中標記基因之間前反饋調(diào)控網(wǎng)絡的動力學方程,數(shù)值模擬結果表明:在外源性轉錄因子OSKM(輸入信號)連續(xù)表達條件下,細胞內(nèi)標記基因Y(如SSEA1)在2天左右開始表達,標記基因Z(如Nanog,Oct4,Sox2)在7天左右表達,這些結果與生物學實驗結果相吻合,能夠解釋重編程不同階段的相關機制。(2)本文選取了 6個測試參數(shù)探究其對加速重編程的影響,結果表明:隨著上游標記基因對下游標記基因的最大激活率的增大,標記基因Z的表達時間將會明顯縮短,即快速的基因表達可以導致更快的重編程過程。同時還發(fā)現(xiàn),外源性轉錄因子OSKM對開啟重編程起重要作用。(3)運用勞斯-霍爾維茨穩(wěn)定性判據(jù)分析了微分方程組解的穩(wěn)定性?紤]到細胞重編程過程具有隨機性,引入高斯白噪聲得到了近似Fokker-Planck方程,運用Langevin理論推導出在穩(wěn)態(tài)附近基因表達水平的Fano因子、協(xié)方差以及敏感性等物理量解析式,最后運用Gillespie算法進行數(shù)值模擬并驗證理論結果的正確性。
【圖文】:

胎盤,多能干細胞,胚胎干細胞,細胞團


圖1.2胚胎干細胞(Embryonic邋Stem邋Ce丨丨s)起源于賽胚(B丨astocyst)內(nèi)部細胞團(Inner邋Mass逡逑Cells),為多能干細胞,它可以成為任何組織,但不包括胎盤。只有桑椹胚(Morula)的細是全能干細胞,可以成為所有組織或胎盤。逡逑

重編程,細胞,碩士學位論文,體細胞


碩士學位論文逡逑MASTER邋DISSERTATION逡逑0%的小鼠和人類體細胞就轉變成了初始的iPS細胞,,并提出了“油門和剎車模型”逡逑Gas邋and邋brakes邋model,圖邋1.4)。逡逑"Stochastic"-robabilisticha?e邐*aDct?rmintsticM-邋hierarchicalhase逡逑
【學位授予單位】:華中師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:O175;Q78

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本文編號:2649303

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