本文關鍵詞：基于轉錄組學測序的長白落葉松材性表達基因

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【摘要】：基于邊合成邊測序(Sequencing By Synthesis,SBS)技術,使用Illumina Hi Seq2500高通量測序平臺對長白落葉松c DNA文庫進行測序。共獲得非重復序列基因58 683條,總長度為55 283 938 bp。將得到的轉錄本使用BLAST軟件將非重復序列基因序列與NR、Swiss-Prot、GO、COG、KEGG數(shù)據(jù)庫比對,通過選擇BLAST參數(shù)Evalue不大于10-5,最終獲得29 350個有注釋信息的基因序列,其中19 292個轉錄本注釋GO編號,有9 112個轉錄本在COG數(shù)據(jù)庫中被注釋并分為25個功能分類,同時注釋到120條KEGG代謝途徑。在得到注釋的轉錄本中搜索到木質素相關基因共68條,其中與木質素合成相關基因29條,與木質素分解代謝相關基因27條;找到了147條纖維素相關基因,其中與纖維素合成相關基因103條,與纖維素分解代謝相關基因44條。
【作者單位】： 林木遺傳育種國家重點實驗室(東北林業(yè)大學);
【關鍵詞】： 長白落葉松 轉錄組 高通量測序 材性基因
【基金】：國家高技術研究發(fā)展計劃(863計劃)(2013AA102704)
【分類號】：S791.22
【正文快照】： 1)國家高技術研究發(fā)展計劃(863計劃)(2013AA102704)。com。通信作者:張含國,林木遺傳育種國家重點實驗室(東北林業(yè)大學),教授。E-mail:hanguozhang1@sina.com。轉錄組(Transcriptome)[1]廣義上指在特定環(huán)境或生理條件下的一個細胞、組織或生物體中所有表達基因的總和。轉錄組

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本文編號：981543