本文關(guān)鍵詞：云南地方稻種抗稻瘟病基因Pi-d3序列變異分析

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【摘要】：對來自云南的80份地方稻種抗稻瘟病基因Pi-d3編碼區(qū)序列進行了PCR擴增并測序分析。結(jié)果表明,與地谷相比,80份云南地方稻種的Pi-d3編碼區(qū)序列(全長2775bp)存在39個變異位點,平均變異率為1.41%。所有材料可以歸為37種單倍型,頻率較高的單倍型是H8(28.8%)、H4(11.3%)、H23(5.0%),其他單倍型頻率較低,顯示了云南地方稻種Pid3基因變異豐富,單倍型類型多,但頻率較低。37種單倍型中存在28個氨基酸差異位點,共編碼33種蛋白,其中18種單倍型共計32份材料(包括12份秈稻品種)出現(xiàn)了假基因,假基因化的頻率較高,可能是粳稻Pi-d3假基因化向秈稻滲透。除已發(fā)現(xiàn)的737位氨基酸假基因位點外,新發(fā)現(xiàn)32和467兩個假基因位點。Pi-d3基因在秈稻、粳稻亞種,水稻、陸稻,黏稻、糯稻的單倍型類型及頻率兩方面均存在差異,表明亞種間或生態(tài)型間發(fā)生了一定的遺傳分化。37種單倍型在云南的地理分布呈大分散、小聚居的特點,普洱、版納、臨滄的單倍型種類最豐富,并以之為中心向外擴展,單倍型種類隨之減少。
【作者單位】： 云南省農(nóng)業(yè)科學院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所/云南省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點實驗室/農(nóng)業(yè)部西南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 云南地方稻種 稻瘟病 Pi-d基因 單核苷酸多態(tài)性
【基金】：國家自然科學基金資助項目(31360331) 科技部基礎(chǔ)性工作專項(2012FY110200) 云南省自然科學基金資助項目(2013FZ146)
【分類號】：S435.111.41
【正文快照】： 水稻是世界上重要的糧食作物,稻瘟病是由稻瘟病菌(Magnaporthe　oryzae;無性態(tài):Pyriculariaoryzae)引起的水稻真菌病害[1],在世界各水稻種植區(qū)均有發(fā)生,可引起水稻大幅減產(chǎn),甚至絕收,嚴重 阻礙了水稻生產(chǎn)的可持續(xù)發(fā)展。稻瘟病抗性可分為垂直抗性和水平抗性兩種類型,垂直抗性

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本文編號：972317