春性甘藍型油菜FCA同源基因可變剪接體的克隆及表達研究
發(fā)布時間:2017-09-30 08:25
本文關(guān)鍵詞:春性甘藍型油菜FCA同源基因可變剪接體的克隆及表達研究
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【摘要】:【目的】克隆特早熟春性甘藍型油菜的FCA同源基因(sBnFCA)及其可變剪接體,并分析該基因的表達模式!痉椒ā扛鶕(jù)擬南芥和蕓薹屬植物FCA基因的DNA序列和cDNA序列設(shè)計引物,用PCR和RT-PCR技術(shù)克隆特早熟春性甘藍型油菜"86號"的FCA同源基因(sBnFCA)及其可變剪接體,對克隆基因及編碼蛋白序列進行生物信息學分析,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,并用qRT-PCR技術(shù)檢測sBnFCA基因在不同發(fā)育時期根、莖、葉、莖尖中的表達量。【結(jié)果】克隆出了sBnFCA基因的全長序列(8 827bp),得到了sBnFCA-γ可變剪接體及一個新的可變剪接體(sBnFCA-5),新的可變剪接體在GenBank中的登錄號為KJ701579.1。sBnFCA-5剪接體的CDS全長1 986bp,編碼662個氨基酸殘基,其推導的氨基酸序列具有2個保守的RRM結(jié)構(gòu)域和1個WW結(jié)構(gòu)域。生物信息學分析顯示,sBnFCA-5與已報道甘藍型油菜BnFCA-γ(AF414188.1)的相似性達99%,與擬南芥FCA-γ的相似性達87%。sBnFCA-5比sBnFCA-γ少了172個堿基序列,是一個跨外顯子剪接體。sBnFCA蛋白相對分子質(zhì)量和理論等電點分別為72.5ku和9.2。基因表達模式分析顯示,sBnFCA-γ和sBnFCA-5在苗期、蕾期、花期的根、莖、葉和莖尖組織中都有表達,sBnFCA-γ在蕾期莖尖和花期葉片中表達量較高,sBnFCA-5在蕾期莖尖和花期葉片中表達量極高。【結(jié)論】克隆的sBnFCA-5為甘藍型油菜sBnFCA基因的一個新的可變剪接體,該基因在春性特早熟甘藍型油菜開花調(diào)控中可能有著重要的調(diào)節(jié)作用。
【作者單位】: 青海大學生態(tài)環(huán)境工程學院;青海大學農(nóng)林科學院;
【關(guān)鍵詞】: 春性甘藍型油菜 基因克隆 FCA同源基因 可變剪接 自主開花途徑
【基金】:國家自然科學基金項目(31360345) 青海省科技廳項目(2013-Z-716) 國家863項目(2011AA10A104) 高層次人才項目(2012-QGC-3) 科技部項目(2013BAD01B05-3)
【分類號】:S565.4
【正文快照】: 開花時間是決定油菜成熟期早晚的一個重要指標,適時開花能保證花朵在適宜的條件下授粉和種子的正常成熟,避免生育后期高溫逼熟或干熱等自然災害的影響,是油菜高產(chǎn)和優(yōu)質(zhì)的重要條件[1]。影響油菜成花的環(huán)境因素很多,其中最關(guān)鍵的因子是溫度和光照,而影響春性甘藍型油菜成花的環(huán),
本文編號:947151
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