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甜玉米胚乳突變基因shrunken2的序列變異解析

發(fā)布時間:2017-09-30 07:02

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【摘要】:Shrunken2基因編碼葡萄糖焦磷酸化酶的大亞基,是玉米淀粉合成途徑中的限速酶,shrunken2是Shrunken2的隱性突變等位基因,對甜玉米品質(zhì)和風(fēng)味的形成起著重要的作用。本研究以玉米B73的Shrunken2基因?yàn)閰⒖夹蛄?在58份甜玉米自交系中進(jìn)行shrunken2基因的重測序,共獲得了7 635 bp的核苷酸序列,涵蓋了20個外顯子,17個內(nèi)含子以及3'UTR區(qū)域;蚨鄳B(tài)性分析發(fā)現(xiàn),在供試群體中共有多態(tài)性位點(diǎn)105個,包括78個SNP和27個Indel。與普通玉米B73的Shrunken2序列之間存在58個多態(tài)性位點(diǎn)差異,包括50個SNP和8個Indel,其中位于編碼區(qū)的SNP位點(diǎn)包含2個同義突變和7個非同義突變。根據(jù)shrunken2基因全長序列和編碼區(qū)序列可將該群體分成14種和4種單倍型。中性檢測表明該基因經(jīng)歷了自然和人工雙重選擇過程。
【作者單位】: 中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所;廣東省作物遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】甜玉米 Shrunken 序列多態(tài)性 中性檢測 單倍型
【基金】:廣東省科學(xué)技術(shù)廳廣東省農(nóng)作物遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)項(xiàng)目(粵科財字(2013)82號) 廣東省農(nóng)業(yè)科技研究團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(2011A020102010) 廣東省科技計劃項(xiàng)目(2009B080701103;2011A030100002;2014A020208061;2016A020208006)共同資助
【分類號】:S513
【正文快照】: *同等貢獻(xiàn)作者**通訊作者,yl.lee@126.comAnalysis of Sequence Polymorphism of shrunken2 in Sweet CornSuo Haicui1,2,3*Zheng Jinrong2,3*Zhang Xiaolan2,3Li Zhijun2,3Li Wu2,3Hu Jianguang2,3Han Fuguang2,3Wang Kehan2,3Wang Li2,3Li Yuliang2,3**1 School of Life Sci

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