本文關(guān)鍵詞：廣州地區(qū)人巨細(xì)胞病毒臨床低傳代病毒株UL142基因的序列特征分析

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【摘要】：目的探討廣州地區(qū)人巨細(xì)胞病毒(HCMV)臨床低傳代病毒株UL142基因的序列特征。方法選取2014年3月至2015年12月在廣州醫(yī)科大學(xué)附屬廣東省婦兒醫(yī)院兒科就診的10例HCMV癥狀性感染患兒的尿液標(biāo)本為研究對象。將從HCMV癥狀性感染患兒尿液標(biāo)本中分離出的病毒株進(jìn)行多重PCR鑒定,對UL142基因全序列克隆到pMD18-T載體上擴(kuò)增并將產(chǎn)物進(jìn)行測序,將測序結(jié)果提交GenBank并與GenBank收錄的其他10株HCMV病毒株的UL142基因進(jìn)行比對分析。結(jié)果從廣州地區(qū)HCMV癥狀性感染患兒尿液中成功分離2株HCMV臨床病毒株,分別命名為HCMV D2和D3;克隆測序后由GenBank收錄,收錄號分別為DQ180384和DQ180370。各HCMV病毒株的UL142基因同源性比對分析發(fā)現(xiàn):UL142基因序列較保守,有69處堿基發(fā)生變異,且均為點(diǎn)突變,無插入及缺失突變;編碼蛋白的氨基酸殘基為306個,序列也較保守,其中28處點(diǎn)突變導(dǎo)致編碼氨基酸的改變,其余點(diǎn)突變均未導(dǎo)致編碼氨基酸改變。不同HCMV病毒株中UL142基因所編碼的氨基酸變異率為0.9%~6.5%。各HCMV病毒株UL142基因編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu)的氨基酸數(shù)目不同,但所有HCMV病毒株UL142基因編碼蛋白的等電點(diǎn)均在6.48~8.27。結(jié)論廣州地區(qū)HCMV臨床低傳代病毒株ULl42基因序列及其編碼產(chǎn)物的氨基酸序列均較為保守,但仍存在一定的多態(tài)性,這提示UL142基因在HCMV感染與致病機(jī)制的研究中可能具有重要作用。
【作者單位】： 廣州醫(yī)科大學(xué)附屬廣東省婦兒醫(yī)院兒科;
【關(guān)鍵詞】： 巨細(xì)胞病毒 臨床低傳代病毒株 ULl 序列分析
【基金】：廣東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(9151008901000085);廣東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2015A030313726) 廣東省醫(yī)學(xué)科研基金項(xiàng)目(A2015133)~~
【分類號】：R725.1
【正文快照】： 作者單位:511442廣州醫(yī)科大學(xué)附屬廣東省婦兒醫(yī)院兒科人巨細(xì)胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)為雙鏈DNA病毒,其基因組龐大,由長獨(dú)特序列(unique long,UL)和短獨(dú)特序列(uniqueshort,US)2個片段組成。HCMV是引起宮內(nèi)感染最常見的病毒之一,在先天性HCMV感染的新生兒中,可引起，

本文編號：932019