本文關鍵詞：寨卡病毒基因序列分析及核酸檢測方法

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【摘要】：目的分析寨卡病毒基因組序列特征,建立寨卡病毒的核酸檢測方法。方法構建81種蟲媒傳播黃病毒和寨卡病毒的系統(tǒng)進化樹,比較寨卡病毒與登革病毒4型、日本腦炎病毒的核酸和氨基酸序列差異,分析亞洲型和非洲型寨卡病毒基因變異位點,尤其是中國的4株輸入性寨卡病毒基因序列。通過比較亞洲型和非洲型寨卡病毒全基因組核酸序列,設計一組寨卡病毒實時熒光定量PCR檢測的引物和探針,并檢測其敏感性與特異性。結果 81種蟲媒傳播黃病毒中,寨卡病毒與Spondweni、Kedougou病毒同源性最近。全基因組核酸序列比較結果顯示寨卡病毒與登革病毒4型的同源性比日本腦炎病毒更近,而氨基酸序列比較結果顯示寨卡病毒與日本腦炎病毒的同源性更近。與傳統(tǒng)亞洲型寨卡病毒比較,廣東GD01株有5個氨基酸突變位點,廣東GDZ16001株有3個,浙江ZJ03株有6個,贛縣VE Ganxian株有33個。所設計的PCR引物和探針對質(zhì)粒標準品檢測呈陽性,檢測下限為100拷貝/mL,對細胞培養(yǎng)的寨卡病毒RNA檢測呈陽性,而對登革病毒1~4型和日本腦炎病毒檢測呈陰性。結論寨卡病毒與Spondweni病毒同源性最近,贛縣VE Ganxian株的高變異顯示寨卡病毒正在快速變異。本研究設計的PCR引物和探針可用于亞洲型和非洲型寨卡病毒株檢測,具有較高的敏感性和特異性。
【作者單位】： 第二軍醫(yī)大學熱帶醫(yī)學與公共衛(wèi)生學系生物防御教研室上海市醫(yī)學生物防護重點實驗室;第二軍醫(yī)大學學員旅學員7隊;
【關鍵詞】： 寨卡病毒 病毒基因組 RNA序列分析 核酸檢測 亞洲
【基金】：上海市衛(wèi)生與計劃生育委員會課題(20154Y125) 上海市公共衛(wèi)生三年行動計劃重點學科建設項目(15GWZK0103)~~
【分類號】：R511;R440
【正文快照】： [Acad J Sec Mil Med Univ,2016,37(6):661-667]寨卡病毒(Zika virus)為單正鏈RNA病毒,是黃病毒科黃病毒屬成員,基因組由10 794個核苷酸組成(MR 766,NC_012532),編碼3個結構基因(核衣殼蛋白C、膜蛋白M和包膜蛋白E)和7個非結構基因(NS1、NS2a、NS2b、NS3、NS4a、NS4b和NS5)。寨

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