本文關(guān)鍵詞：玉米大斑病菌GPCRs超家族的基因鑒定及其在孢子發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄模式

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【摘要】：G蛋白偶聯(lián)受體(G protein-coupled receptors,GPCRs)廣泛存在于動(dòng)物、植物以及微生物中,是最大的涉及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的膜受體家族。本研究通過基于隱馬爾科夫模型的HMMER 3.0軟件搜索玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)基因組數(shù)據(jù)庫(kù),鑒定并獲得GPCRs超家族基因及其基因組定位;采用MEGA 6.0軟件進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析;通過通用樣品數(shù)據(jù)系統(tǒng)(generalized sample data system,GSDS)工具進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析;利用Inter Pro和SMART工具分析GPCRs的保守結(jié)構(gòu)域。進(jìn)一步利用q RT-PCR技術(shù),對(duì)所確定的GPCR基因在分生孢子發(fā)育形成侵染結(jié)構(gòu)的過程中不同階段的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行分析。結(jié)果表明,在玉米大斑病菌基因組中至少有9個(gè)典型的GPCR,其中3個(gè)屬氮源感應(yīng)因子類,信息素受體和碳源感應(yīng)因子類各2個(gè),類環(huán)磷酸腺苷受體和真菌視蛋白類各1個(gè)。這些基因散布在玉米大斑病菌基因組中,且結(jié)構(gòu)復(fù)雜多樣,但所有成員編碼產(chǎn)物均由N端、7個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域、3個(gè)胞內(nèi)環(huán)、3個(gè)胞外環(huán)及C端組成。每個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域包含20~25個(gè)氨基酸。以分生孢子為對(duì)照,所有基因在附著胞成熟時(shí)期接種后12 h(12 hours post inoculation,12 hpi)均顯著下調(diào)(P0.05);除基因St Rtc1和Stfdd123以外,全部基因整體變化趨勢(shì)均呈現(xiàn)上調(diào)/持平(3 hpi)-上調(diào)(6 hpi)-下調(diào)(12 hpi)-上調(diào)(24 hpi)的規(guī)律,尤其在侵入絲形成時(shí)期(24 hpi)顯著上調(diào)(P0.05)。在附著胞形成時(shí)期(6 hpi),僅St Ste2p和St Rtc2表達(dá)顯著上調(diào)。St Rtc1和Stfdd123在各階段中的表達(dá)量與對(duì)照差異不顯著或顯著降低。本研究為深入解析植物病原真菌GPCR超家族的功能提供了理論依據(jù)。
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/河北省植物生理與分子病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;河北省農(nóng)林科學(xué)院谷子研究所;
【關(guān)鍵詞】： 玉米大斑病菌 G蛋白偶聯(lián)受體 侵染 轉(zhuǎn)錄模式
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31301616) 河北省高等學(xué)校青年拔尖人才計(jì)劃項(xiàng)目(No.BJ2014349Y) 河北省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.C2014204111;No.C2016204160)
【分類號(hào)】：S435.131.4
【正文快照】： *同等貢獻(xiàn)作者G蛋白偶聯(lián)受體(G protein coupled receptors,GPCRs)是拓?fù)錁?gòu)象為7次跨膜的受體(王迪等,2012),作為最大的膜受體家族,是令世人矚目的藥物靶標(biāo)之一(趙玉華,2002)。GPCR通過與G蛋白偶聯(lián)參與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程,能夠調(diào)節(jié)感官感應(yīng)、趨化性、神經(jīng)傳遞、細(xì)胞交流、感光、嗅覺

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本文編號(hào)：900408