本文關(guān)鍵詞：雞importin β1基因的克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：[目的]對(duì)雞importin β1基因進(jìn)行克隆和生物信息學(xué)分析。[方法]根據(jù)Gen Bank公布的雞importin β1基因序列(XM_015299473)設(shè)計(jì)合成特異性引物,通過RT-PCR從DF-1細(xì)胞中擴(kuò)增importin β1基因CDS區(qū)并進(jìn)行克隆和測(cè)序,利用生物信息學(xué)工具對(duì)其理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)進(jìn)化樹進(jìn)行分析。[結(jié)果]雞importin β1基因CDS全長(zhǎng)2 268bp,共編碼755個(gè)氨基酸,該蛋白等電點(diǎn)為4.61,相對(duì)分子質(zhì)量84.15 k Da,分子式為C3712H5901N979O1152S46。蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示,雞importin β1蛋白含有豐富的二級(jí)結(jié)構(gòu),以α-螺旋為主(占64.90%)。importin β1基因同源性及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明雞與鵪鶉的親緣關(guān)系最近。[結(jié)論]雞importin β1基因的克隆和生物信息學(xué)分析為進(jìn)一步研究其功能奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;貴州大學(xué)高原山地動(dòng)物遺傳育種與繁殖教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 雞importin β基因 克隆 生物信息學(xué)
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(“新城疫病毒M蛋白細(xì)胞核定位的分子機(jī)制及功能研究”,No.31502074) 貴州省省校合作計(jì)劃項(xiàng)目(“貴州省三穗鴨源新城疫病毒監(jiān)測(cè)及其防控體系研究”,黔科合LH字[2014]7669號(hào)) 貴州省科學(xué)技術(shù)基金項(xiàng)目(“以新城疫病毒為載體的新型鴨疫里默氏桿菌疫苗的研制及免疫保護(hù)效力研究”,黔科合J字[2015]2054號(hào)) 貴州大學(xué)引進(jìn)人才科研項(xiàng)目(“三穗鴨源新城疫病毒SS-1株反向遺傳操作平臺(tái)的建立及其初步應(yīng)用”,貴大人基合字[2014]10號(hào))
【分類號(hào)】：S831
【正文快照】： importinβ蛋白是一類在真核生物中廣泛分布的核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)受體蛋白,到目前為止,在人類細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)importinβ家族成員超過20個(gè),而在酵母細(xì)胞中大約有14個(gè)成員[1]。importinβ1蛋白屬于importinβ家族重要成員之一,其在細(xì)胞的基因轉(zhuǎn)錄、細(xì)胞周期調(diào)控及增殖分化等過程中發(fā)揮著重要作

【相似文獻(xiàn)】

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1 胡甘雨;司風(fēng)玲;車燕飛;張玉娟;陳斌;;蔥蠅過氧化氫酶基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J];西南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2014年01期

2 姚楊;黃原;蘇杰;;東亞三角渦蟲Rab蛋白cDNA序列的克隆與生物信息學(xué)分析[J];生物技術(shù)通報(bào);2012年02期

3 張媛;張鐘仁;咸麗霞;邢國芳;;玉米谷胱甘肽過氧化物酶生物信息學(xué)分析[J];山西農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年08期

4 晁哲;林哲敏;劉海隆;張星;鄭心力;黃麗麗;謝亮;王峰;;雞熱休克蛋白70基因克隆、單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)及生物信息學(xué)分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2014年03期

5 蔡小寧;陳茜;楊平;任源浩;;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息學(xué)分析[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年03期

6 陳塵;王政軍;曹鑫林;王U喼，

本文編號(hào)：898435