豬博卡病毒不同基因型三重PCR檢測方法的建立及初步應(yīng)用
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【摘要】:為鑒別豬博卡病毒1型、2型和3型3種基因型,根據(jù)豬博卡病毒基因序列分別設(shè)計3對針對保守區(qū)域的引物進行PCR擴增,擴增目的片段大小分別為645 bp(PBoV1型)、352 bp(PBoV2型)和259 bp(PBoV3型)。通過引物濃度和退火溫度等條件優(yōu)化,首次建立了同時檢測豬博卡病毒3種基因型的三重PCR方法。所建立的三重PCR方法擴增其他豬病病毒結(jié)果均為陰性,最低檢測限為8×10-7ng/μL。結(jié)果表明,該方法具有較好的特異性和敏感性。對臨床樣品進行三重PCR和單項PCR檢測,對比結(jié)果顯示符合率為100%。該方法的建立為豬博卡病毒3種不同基因型的鑒別檢測提供了有效手段。
【作者單位】: 北京農(nóng)學(xué)院動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;北京市農(nóng)林科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所畜禽疫病防控技術(shù)北京市重點實驗室;北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】: 豬博卡病毒 基因型 三重PCR 檢測
【基金】:北京市農(nóng)林科學(xué)院科技創(chuàng)新能力建設(shè)專項(KJCX20140409) 北京市科技計劃項目(Z131100003113015)
【分類號】:S852.65
【正文快照】: 博卡病毒(Bocavirus)為細(xì)小病毒科、細(xì)小病毒亞科、博卡病毒屬的成員。豬博卡病毒(Porcine bo-cavirus,PBo V)是2009年在患有仔豬斷奶后多系統(tǒng)衰竭綜合征的豬淋巴結(jié)中,通過隨機置換擴增的方法和高通量測序技術(shù)在瑞典首次發(fā)現(xiàn)[1]。由于對PBo V的研究仍處于起步階段,其單獨的致
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