熱不對稱交錯PCR(Thermal Asymmetric Interlaced PCR,Tail
本文關鍵詞:轉基因水稻T-DNA側翼序列的擴增與分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
在利用特異引物和隨機引物進行PCR中一般有3種產物生成: ①由特異性引物和簡并引物擴增出的產物; ②由同一特異性引物擴增出的產物; ③由同一簡并引物擴增出的產物。
種目標產物可以通過以嵌套的特異性引物進行的后續(xù)反應來消除。
第二次反應則將第一級反應的產物稀釋1000倍作為模板,通過10次熱不對稱的超級循環(huán),使特異性產物被選擇地擴增,而非特異產物含量極低。
第三次反應又將第二次反應的產物稀釋作模板,再設置普通的PCR反應或熱不對稱超級循環(huán),通過上述3次PCR反應可獲得與已知序列鄰近的目標序列。
Tail-PCR的技術優(yōu)點及技術難點。
Tail-PCR技術的優(yōu)點:
1)簡單。只要設計好引物,即可以用基因組DNA作模板直接篩選到目標序列,節(jié)省了PCR反應前后的許多費時,費力的操作程序。
2)特異性高。用短的簡并引物和長的特異性嵌套引物相組合,通過不對稱的溫度循環(huán)和分級反應,使反應體系有利于特異引物的擴增,最終的擴增產物中目的片段占絕對優(yōu)勢,反應產物可以直接用作探針標記和測序模板。
3)高效靈敏。使用任何一個簡并引物,在60%-80%的反應中能夠產生特異性產物。
4)快速。整個Tail-PCR反應循環(huán)能夠在1天內完成,可以快速地獲得目標片段。
5)不涉及連接反應,反應產物準確可靠,重復性好。
但是,,Tail-PCR反應需要較多的引物組合,并且由于簡并引物存在有限的結合位點,對于個別的側翼序列,即使使用不同的簡并引物也難以擴增到陽性結果。整個Tail-PCR需要一系列連續(xù)的反應,反應條件的設置要求比較精細。
[1] Liu Yao- Guang,Robert F Whitter. Thermal asymmetric interlaced PC R:automatable amplification and sequencing of insert end fragment from Pl and YAC clones for chromosome walking[ J] . Genomics,1995 ,25 :674一681
[2」Liu Yao- Guang,Huang Ning.Efficient amplification of insert end sequences from bacterial artificial chromosome clones by thermal asym-metric interlaced PC風J] Plant Molecular Biology Reporter,1998 ,16(2) :175一181
[3] 方進,瞿文學,王文明,等. 轉基因水稻T-DNA側翼序列的擴增與分析[J]. 遺傳學報,2001,2(4):345-357
本文關鍵詞:轉基因水稻T-DNA側翼序列的擴增與分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:88370
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/88370.html