本文關(guān)鍵詞：中國(guó)西南地區(qū)主要地方綿羊Cytb基因遺傳多樣性及系統(tǒng)進(jìn)化的研究

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【摘要】：目前對(duì)我國(guó)西南地區(qū)綿羊(Ovis areis)群體研究的報(bào)道較少,為探究我國(guó)西南地區(qū)綿羊遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)和演進(jìn)歷史,本研究利用Oligo 6.0軟件設(shè)計(jì)引物對(duì)8個(gè)地方綿羊群體和2個(gè)引入品種群體183只線粒體細(xì)胞色素b(cytochrome,Cytb)基因全長(zhǎng)進(jìn)行測(cè)序,并利用MEGA 5.2、Dna SP 5、Phylip 3.695和Network 4.0等軟件對(duì)其群體進(jìn)行分析。其研究結(jié)果表明,所發(fā)現(xiàn)的153個(gè)多態(tài)位點(diǎn)共確定了62種單倍型;10個(gè)綿羊群體的平均單倍型多樣度為0.792;平均核苷酸多樣度為0.002 43;平均核苷酸差異數(shù)為5.054。10個(gè)群體的核苷酸多樣度(nucleotide diversity,Pi)差異較大,變化范圍為0.001 28~0.006 55,核苷酸多樣度最大和最小的群體分別為以貴德黑裘皮羊(0.006 55)和昭通綿羊(0.001 28);單倍型多樣度(haplotype diversity,Hd)最高和最低的群體分別是西藏羊(0.924)和騰沖綿羊(0.582),結(jié)果說明,云南3個(gè)綿羊群體的遺傳多樣性水平較低,其他幾個(gè)綿羊群體的遺傳多樣性水平較高。分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)分析結(jié)果說明,10個(gè)綿羊群體間的遺傳變異為13%,而87%為群體內(nèi)的遺傳變異,兩者比例懸殊,說明所選10個(gè)綿羊群體間的變異絕大部分來自群體內(nèi)。通過構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹和網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)分析顯示本研究中綿羊群體至少可以分為3個(gè)支系,但是西南群體以支系A(chǔ)和支系B為主。本研究結(jié)果為制定我國(guó)西南地區(qū)綿羊保種方案以及合理利用等提供理論參考。
【作者單位】： 全國(guó)畜牧總站畜禽遺傳資源保存利用中心;洛陽(yáng)市洛瑞牧業(yè)有限公司;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 綿羊 細(xì)胞色素b基因(Cytb) 遺傳多樣性 群體結(jié)構(gòu) 演進(jìn)歷史
【基金】：物種資源保護(hù)畜禽種質(zhì)資源保護(hù)項(xiàng)目資金(No.農(nóng)財(cái)發(fā)[2014]35號(hào))
【分類號(hào)】：S826
【正文快照】： 650201線粒體DNA(mitochondrial DNA,mt DNA)具有分子量小、突變率高、進(jìn)化速度快和無組織特異性等優(yōu)點(diǎn)。突變率高或任何突變都可能會(huì)影響線粒體內(nèi)部不同核酸區(qū)域的進(jìn)化速率,這就適用于不同水平的進(jìn)化分析,從而也使mt DNA標(biāo)記成為研究家畜遺傳多樣性及演進(jìn)歷史有力的工具(Zede

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前7條

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7 哈麗亞;利用線粒體Cytb基因檢測(cè)骨頂雞（Fulica atra）種內(nèi)巢寄生的初步研究[D];東北林業(yè)大學(xué);2014年

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