本文關(guān)鍵詞：谷子、大麥、高粱抗黃矮病候選基因的生物信息學(xué)比較分析

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【摘要】：黃矮病是禾本類作物的主要病害之一,該病主要由大麥黃矮病毒侵染所致,侵染該病毒后植株生理活動(dòng)紊亂,葉片黃化至紅化,結(jié)實(shí)率低,嚴(yán)重影響農(nóng)作物的產(chǎn)量。大麥黃矮病毒最早發(fā)現(xiàn)于大麥作物中,對大麥抗黃矮病的研究較早,但至今仍未從大麥克隆到黃矮病抗病基因。利用病毒誘導(dǎo)基因沉默系統(tǒng)和轉(zhuǎn)基因技術(shù),TIRB基因被驗(yàn)證具有抗黃矮病功能,是小麥抗黃矮病的關(guān)鍵基因。我們通過用小麥TIRB基因序列,在谷子、高粱和大麥基因庫進(jìn)行BLAST比對,發(fā)掘了谷子、高粱和大麥抗黃矮病候選基因,并運(yùn)用生物信息學(xué)軟件,分析、比較了這些基因所表達(dá)蛋白的理化性質(zhì),蛋白的親疏水性及亞細(xì)胞定位,信號肽預(yù)測及三級結(jié)構(gòu)等。不同物種中的這些蛋白相似的性質(zhì)暗示著它們可能執(zhí)行相近的抗病機(jī)制。總之,三種候選基因的發(fā)現(xiàn),對于通過生物信息手段發(fā)掘作物抗病基因具有一定的指導(dǎo)意義。
【作者單位】： 河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;湖南大學(xué)生物學(xué)院;河北松塔坡農(nóng)業(yè)開發(fā)有限公司;
【關(guān)鍵詞】： 谷子 大麥 高粱 黃矮病 抗病基因 生物信息學(xué)
【基金】：河北省自然科學(xué)基金(C2015201176) 教育部留學(xué)回國人員科研啟動(dòng)基金(教外司留2011-1139) 河北大學(xué)引進(jìn)人才項(xiàng)目(2010-185);河北大學(xué)研究生創(chuàng)新資助項(xiàng)目(X2015067) 河北省研究生創(chuàng)新資助項(xiàng)目(S2016022) 河北松塔坡農(nóng)業(yè)開發(fā)有限公司高光效育種研究基地基金共同資助
【分類號】：S435.15;S435.123;S435.14
【正文快照】： Comparative Bioinformatics Analysis of Candidate Genes Resistant to Yell-ow Dwarf Disease in Setaria italica,Hordeum vulgare and Sorghum bicolorCheng Jinjin1Liu Hongyun1Fan Hui1Cheng Siyuan2Zhang Shumin1Chen Yulong3Liu Zheng1,3*1 College of Life Sciences

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本文編號：873664