本文關(guān)鍵詞：家兔ANGPTL4基因與家兔生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析

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【摘要】：血管生成素樣蛋白4(Angiopoietin-like protein 4, ANGPTL4)類血管生成素基因是與脂肪代謝相關(guān)的分泌蛋白,而且ANGPTL4基因不僅調(diào)節(jié)脂肪和能量代謝,還參與到細(xì)胞增殖和凋亡調(diào)控以及控制肌肉生長(zhǎng)過程,由此在肌肉生長(zhǎng)發(fā)育過程中發(fā)揮著重要的作用。本試驗(yàn)選取天府黑兔、伊拉兔和新西蘭兔為試驗(yàn)材料,通過PCR產(chǎn)物直接測(cè)序法檢測(cè)ANGPTL4基因編碼區(qū)SNPs位點(diǎn),通過連鎖不平衡分析和PCR-RFLP技術(shù)對(duì)遺傳突變位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,并將SNPs位點(diǎn)與家兔生長(zhǎng)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析。主要結(jié)果如下：1.通過對(duì)天府黑兔、新西蘭兔和伊拉兔三個(gè)品種在35、70和84日齡的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行比較后,結(jié)果表明三個(gè)品種之間差異不顯著,但是多重比較表明天府黑兔在70日齡和84日齡體重顯著高于伊拉兔(P0.05)；新西蘭兔在28日齡體重顯著高于伊拉兔(P0.05),并且在35日齡體重高于其它品種；新西蘭兔在70、84日齡體重均高于伊拉兔。不同家兔品種之間在28-84日齡平均日增重差異不顯著,但天府黑兔平均日增重高于新西蘭兔和伊拉兔；新西蘭兔高于伊拉兔。2.在ANGPTL4基因外顯子6中共檢測(cè)出3個(gè)SNP位點(diǎn),其中一個(gè)為錯(cuò)義突變,其它兩個(gè)是同義突變,分別為：c.827 GA、c.867 TC和c.975 TC。通過SMART在線分析軟件預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域發(fā)現(xiàn)這三個(gè)位點(diǎn)均位于FBG結(jié)構(gòu)域上。然后通過連鎖不平衡分析表明c.827 GA與其它兩個(gè)SNPs位點(diǎn)高度連鎖(r20.75),由此可以選擇c.827 GA位點(diǎn)作為遺傳效應(yīng)分析位點(diǎn),進(jìn)行后續(xù)基因多態(tài)性研究。3.在3個(gè)家兔品種群體內(nèi),對(duì)c.827 GA位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,檢測(cè)到三個(gè)家兔群體內(nèi)AA、AG和GG三種基因型,均為中度多態(tài)(0.25PIC0.50)；χ2檢驗(yàn)表明c.827 GA位點(diǎn)在三個(gè)家兔群體內(nèi)處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P0.05)。4. ANGPTL4基因的c.827 GA位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析表明在三個(gè)品種中,c.827 GA在70、84日齡體重和28-84日齡平均日增重的遺傳效應(yīng)達(dá)到顯著水平(P0.05)。其中,GG基因型個(gè)體70、84日齡體重以及28-84日齡平均日增重均顯著高于AA基因型個(gè)體(P0.05),高于AG基因型個(gè)體；GG基因型個(gè)體28日齡、35日齡體重高于AA和AG型個(gè)體。
【關(guān)鍵詞】：家兔 ANGPTL4 生長(zhǎng)性狀 關(guān)聯(lián)性分析
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S829.1
【目錄】：

• 摘要5-6
• ABSTRACT6-10
• 1 文獻(xiàn)綜述10-17
• 1.1 概述10-11
• 1.2 ANGPTLs家族11-12
• 1.3 ANGPTL4基因研究進(jìn)展12-15
• 1.3.1 發(fā)現(xiàn)及命名12-13
• 1.3.2 結(jié)構(gòu)與功能13
• 1.3.3 與脂代謝相關(guān)研究13-15
• 1.4 候選基因法15-17
• 1.4.1 分子遺傳標(biāo)記15-16
• 1.4.2 PCR-RFLP技術(shù)16-17
• 1.5 試驗(yàn)?zāi)康募爸饕獌?nèi)容17
• 1.5.1 試驗(yàn)?zāi)康?/span>17
• 1.5.2 試驗(yàn)主要內(nèi)容17
• 2 材料與方法17-25
• 2.1 試驗(yàn)材料17-18
• 2.2 主要儀器及試劑18-19
• 2.2.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器18
• 2.2.2 主要試劑及試劑配制18-19
• 2.2.3 主要器械消毒及清洗處理19
• 2.3 試驗(yàn)方法19-21
• 2.3.1 家兔生長(zhǎng)性狀測(cè)定19-20
• 2.3.2 總RNA提取20
• 2.3.3 總RNA檢測(cè)20-21
• 2.3.4 cDNA的合成21
• 2.4 基因組DNA提取及檢測(cè)21-22
• 2.4.1 基因組DNA提取21
• 2.4.2 檢測(cè)DNA質(zhì)量21-22
• 2.5 SNPs位點(diǎn)檢測(cè)22-24
• 2.5.1 特異性引物設(shè)計(jì)22
• 2.5.2 編碼區(qū)SNP位點(diǎn)檢測(cè)22-23
• 2.5.3 PCR-RFLP酶切分型23-24
• 2.6 數(shù)據(jù)分析處理24-25
• 2.6.1 數(shù)據(jù)處理24-25
• 2.6.2 試驗(yàn)分析軟件25
• 3 結(jié)果分析25-31
• 3.1 比較分析不同家兔品種的生長(zhǎng)性狀25-26
• 3.2 DNA提取結(jié)果26
• 3.3 SNPs位點(diǎn)的檢測(cè)26-28
• 3.4 候選SNP位點(diǎn)的篩選28-29
• 3.5 ANGPTL4基因遺傳效應(yīng)分析29-31
• 3.5.1 c.827 G>A位點(diǎn)基因型和等位基因頻率29
• 3.5.2 ANGPTL4基因多態(tài)性分析29-30
• 3.5.3 c.827 G>A位點(diǎn)與家兔生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性分析30-31
• 4 討論31-35
• 4.1 PCR反應(yīng)體系條件優(yōu)化分析31-32
• 4.2 不同家兔品種的生長(zhǎng)性狀分析32-33
• 4.3 ANGPTL4基因遺傳多態(tài)性分析33-34
• 4.4 ANGPTL4基因與家兔生長(zhǎng)性狀相關(guān)性分析34-35
• 5 結(jié)論35-36
• 參考文獻(xiàn)36-42
• 致謝42

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：843605