大鱗副泥鰍角蛋白18基因cDNA的全長克隆與序列分析
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【摘要】:角蛋白18(K18)是角蛋白的一種,為中間纖維蛋白,是細胞骨架的必要組成部分。采用RACE法克隆了大鱗副泥鰍K18基因cD NA的全長序列,并運用實時熒光定量PCR技術(shù)探討其在不同組織中的表達。結(jié)果表明,克隆得到的大鱗副泥鰍K18基因cD NA序列全長為1 718 bp,其中包含1個長1 296 bp開放閱讀框,編碼431個氨基酸,蛋白質(zhì)相對分子量48.66 ku。同源性分析顯示,大鱗副泥鰍K18與泥鰍的相似性最高為98%,與斑馬魚、金魚、虹鱒、白斑狗魚等物種K18也存在不同程度的相似性。系統(tǒng)進化分析表明,大鱗副泥鰍與其他物種的K18系統(tǒng)發(fā)育同源,并與泥鰍的關(guān)系最為密切。通過實時熒光定量PCR分析,K18基因在大鱗副泥鰍的腸、肌肉、胃、心臟、肝臟、精巢、卵巢、脾臟等8種組織中都有表達,其中,腸表達最高,心臟最低。研究旨在為大鱗副泥鰍的分子生物學(xué)研究提供參考資料,并為更好地了解大鱗副泥鰍細胞骨架結(jié)構(gòu)系統(tǒng)提供依據(jù)。
【作者單位】: 浙江省淡水水產(chǎn)研究所/農(nóng)業(yè)部淡水漁業(yè)健康養(yǎng)殖重點實驗室/浙江省淡水水產(chǎn)遺傳育種重點實驗室;上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;浙江省慶元縣水利局水產(chǎn)技術(shù)推廣站;
【關(guān)鍵詞】: 角蛋白(K) 大鱗副泥鰍 克隆 定量 表達
【基金】:浙江省淡水水產(chǎn)遺傳育種重點實驗室建設(shè)項目(2014F10037) 浙江省重大科技專項(2013C02009) 浙江省公益技術(shù)研究項目(2010C32033,2012C22059)~~
【分類號】:S917.4
【正文快照】: 角蛋白(keratin)屬于中間纖維蛋白(intermediate filament proteins,IF蛋白),是細胞骨架的主要組成成份[1],不僅對于維持細胞形態(tài)起到一定作用[2],而且與細胞信號通路有關(guān)[3]。在人類中,角蛋白由54個基因組成,可劃分為Ⅰ型角蛋白(K9 K40)和Ⅱ型角蛋白(K1-K8,K71-K86)兩類家族
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本文編號:824530
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