本文關(guān)鍵詞：雞白痢沙門菌spiC基因克隆與生物信息學分析

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【摘要】：為了研究雞白痢沙門菌SpiC蛋白的功能,以雞白痢沙門菌S06004基因組DNA為模板PCR擴增spiC基因,進行克隆測序和生物信息學分析,并調(diào)查該基因在255株不同年代雞白痢沙門菌分離株中的分布與進化情況。結(jié)果顯示,雞白痢沙門菌spiC基因全長384bp,編碼127個氨基酸,在不同年代分離株中穩(wěn)定存在。推導SpiC蛋白無跨膜區(qū)、信號肽和卷曲螺旋結(jié)構(gòu),有1處酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點,2處N-豆蔻�；稽c,預測線性抗原表位主要分布在15-20、29-35、52-53、70-72、83-85、89-94aa。利用SWISS MODEL在線程序建模,得到SpiC三維結(jié)構(gòu)模型。同源性及進化分析顯示spiC基因僅存在于沙門菌中且比較保守,雞白痢沙門菌SpiC蛋白與沙門菌腸道亞種親緣關(guān)系最近。
【作者單位】： 揚州大學江蘇省人獸共患病學重點實驗室/江蘇省動物重要疫病與人獸共患病防控協(xié)同創(chuàng)新中心;
【關(guān)鍵詞】： 雞白痢沙門菌 SpiC蛋白 生物信息學分析
【基金】：863項目(2011AA10A212) 江蘇省自然科學基金(BK20151306) 中國博士后基金(2014M551670) 國家自然科學基金項目(31230070)
【分類號】：S858.31
【正文快照】： 沙門菌是一類兼性胞內(nèi)寄生病原菌,能引起人和動物多種不同癥狀表現(xiàn)的沙門菌病,在醫(yī)學、獸醫(yī)學和公共衛(wèi)生學領(lǐng)域備受重視[1-2]。雞白痢沙門菌作為一種宿主專嗜性血清型,主要侵害20日齡以內(nèi)的雛雞,表現(xiàn)出高發(fā)病率和病死率,對我國家禽業(yè)的發(fā)展危害極大。沙門菌的致病性涉及多種毒

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