本文關(guān)鍵詞：基于目標基因芯片數(shù)據(jù)預(yù)測lncRNAs調(diào)控腦缺血再灌注損傷后的作用效應(yīng)

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【摘要】：長鏈非編碼RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)在細胞中有重要調(diào)控作用。已有研究報道,腦缺血再灌注損傷可誘導(dǎo)大量lncRNAs表達水平的改變,然而其具體作用機理未知。現(xiàn)從GEO數(shù)據(jù)庫中下載基因芯片數(shù)據(jù),分析損傷后腦組織中l(wèi)ncRNAs和mRNAs的表達改變。結(jié)果顯示27條lncRNAs和408條mRNAs表達上調(diào),9條lncRNAs和31條mRNAs表達下調(diào)。同時,基因本體論和通路富集分析顯示差異表達的轉(zhuǎn)錄本在免疫和炎癥反應(yīng)、細胞凋亡調(diào)控等生物過程及相關(guān)通路顯著富集。此外,基于lncRNAs目標預(yù)測程序和lncRNAs-mRNAs共調(diào)控網(wǎng)絡(luò),對序列數(shù)據(jù)和表達數(shù)據(jù)進行綜合分析,發(fā)現(xiàn)差異表達lncRNAs參與調(diào)控細胞凋亡、免疫和炎癥反應(yīng),并推測出linc RNA(chr1 9:5771 425-5848475_F)、lincRNA(chr1:1 37503023-1 37625604_R)和lincRNA(chr1 4:21 029450-21 049451_F)等lncRNAs潛在的靶基因和調(diào)控機制。這些發(fā)現(xiàn)提示lncRNAs廣泛參與調(diào)控腦缺血再灌注損傷,為缺血性腦卒中損傷機制和治療方案提供新的研究方向。
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院;南京醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 腦缺血 長鏈非編碼RNA 免疫反應(yīng) 炎癥反應(yīng) 生物信息學(xué)預(yù)測 基因芯片數(shù)據(jù) GEO數(shù)據(jù)庫
【基金】：國家大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計劃項目(201310312015Z)
【分類號】：R743.3
【正文快照】： 腦卒中是威脅人類健康的重大疾病之一。根據(jù)病因,腦卒中可分為缺血性和出血性兩種類型,其中缺血性腦卒中約占腦卒中病人總數(shù)的60%~80%。缺血性腦卒中開始于大腦動脈的堵塞,缺血區(qū)在低氧低糖的情況下能量代謝發(fā)生改變,導(dǎo)致細胞離子平衡紊亂、酸中毒、炎癥反應(yīng)等一系列事件的發(fā)，

本文編號：816521