本文關鍵詞：基于目標基因芯片數據預測lncRNAs調控腦缺血再灌注損傷后的作用效應

  更多相關文章： 腦缺血 長鏈非編碼RNA 免疫反應 炎癥反應 生物信息學預測 基因芯片數據 GEO數據庫

【摘要】：長鏈非編碼RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)在細胞中有重要調控作用。已有研究報道,腦缺血再灌注損傷可誘導大量lncRNAs表達水平的改變,然而其具體作用機理未知。現從GEO數據庫中下載基因芯片數據,分析損傷后腦組織中l(wèi)ncRNAs和mRNAs的表達改變。結果顯示27條lncRNAs和408條mRNAs表達上調,9條lncRNAs和31條mRNAs表達下調。同時,基因本體論和通路富集分析顯示差異表達的轉錄本在免疫和炎癥反應、細胞凋亡調控等生物過程及相關通路顯著富集。此外,基于lncRNAs目標預測程序和lncRNAs-mRNAs共調控網絡,對序列數據和表達數據進行綜合分析,發(fā)現差異表達lncRNAs參與調控細胞凋亡、免疫和炎癥反應,并推測出linc RNA(chr1 9:5771 425-5848475_F)、lincRNA(chr1:1 37503023-1 37625604_R)和lincRNA(chr1 4:21 029450-21 049451_F)等lncRNAs潛在的靶基因和調控機制。這些發(fā)現提示lncRNAs廣泛參與調控腦缺血再灌注損傷,為缺血性腦卒中損傷機制和治療方案提供新的研究方向。
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學第一臨床醫(yī)學院;南京醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院;
【關鍵詞】： 腦缺血 長鏈非編碼RNA 免疫反應 炎癥反應 生物信息學預測 基因芯片數據 GEO數據庫
【基金】：國家大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練計劃項目(201310312015Z)
【分類號】：R743.3
【正文快照】： 腦卒中是威脅人類健康的重大疾病之一。根據病因,腦卒中可分為缺血性和出血性兩種類型,其中缺血性腦卒中約占腦卒中病人總數的60%~80%。缺血性腦卒中開始于大腦動脈的堵塞,缺血區(qū)在低氧低糖的情況下能量代謝發(fā)生改變,導致細胞離子平衡紊亂、酸中毒、炎癥反應等一系列事件的發(fā)，

本文編號：816521