本文關(guān)鍵詞：地黃環(huán)烯醚萜合成后修飾相關(guān)基因的挖掘與分析

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【摘要】：本研究采用Illumina Hi Seq 2500技術(shù)對地黃脫毒苗進行轉(zhuǎn)錄組測序,獲得了地黃轉(zhuǎn)錄組信息,并對構(gòu)建好的地黃基因Unigene庫進行蛋白功能注釋、KEGG代謝通路分析等生物信息學(xué)分析,以期大規(guī)模挖掘與地黃環(huán)烯醚萜類成分生物合成及后修飾相關(guān)的基因。應(yīng)用高通量測序技術(shù)對地黃組培苗進行轉(zhuǎn)錄組測序,得到13.61Gb的干凈數(shù)據(jù),De novo組裝后共獲得70778條Unigene,其中33.428(47.23%)條unigenes能被Nr、Swiss-Prot、Pfam、KOG、KEGG、GO和COG等公共數(shù)據(jù)庫注釋。進一步對被注釋的地黃萜類生物合成及后修飾相關(guān)基因進行挖掘發(fā)現(xiàn),地黃轉(zhuǎn)錄組中共有81個Unigene參與萜類骨架合成;共有226個Unigene可能參與CYP450介導(dǎo)的環(huán)烯醚萜骨架的氧化修飾;共有102個Unigene與糖基轉(zhuǎn)移酶相關(guān)。地黃轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫的獲得為探索地黃環(huán)烯醚萜類成分的生物合成研究奠定了基礎(chǔ),為后續(xù)基因功能的分析等研究提供分子水平依據(jù)。
【作者單位】： 河南中醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院河南中醫(yī)學(xué)院呼吸疾病診療與新藥研發(fā)河南省協(xié)同創(chuàng)新中心;
【關(guān)鍵詞】： 轉(zhuǎn)錄組 地黃 細(xì)胞色素氧化酶p 糖基轉(zhuǎn)移酶
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(81603232) 國家“十二五”科技支撐計劃項目(2011BAl06802) 河南省高等學(xué)校重點科研項目計劃(15A360036) 河南中醫(yī)學(xué)院博士科研基金(BSJJ2011-07) 社會發(fā)展領(lǐng)域河南科技攻關(guān)計劃項目(122101310400)
【分類號】：S567.234
【正文快照】： 地黃(Rehmannia glutinosa Libosch.ex Fisch)為玄參科(Scrophulariaceae)多年生草本植物,塊根及其加工品分別作為鮮地黃、生地黃和熟地黃入藥,為歷代中醫(yī)常用中藥。環(huán)烯醚萜類化學(xué)成分是地黃發(fā)揮療效的主要物質(zhì)基礎(chǔ)。環(huán)烯醚萜屬于臭乙二醛的縮醛衍生物,在植物體內(nèi)常以與糖形，

本文編號：816192