2個野扁桃自交不親和S-RNase基因全長的克隆與序列分析
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【摘要】:【目的】克隆新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schlecht.)自交不親和性花柱特異性決定因子編碼基因SRNase全長序列,為自交不親和性的分子調(diào)控奠定基礎(chǔ)!痉椒ā恳孕陆氨馓一ㄖ鶠樵嚥,利用RT-PCR和RACE技術(shù)克隆S-RNase基因全長,采用BLAST和ORF Finder對核酸序列進(jìn)行分析,利用CDD、Prot Param、Tmpred、Signal P、Target P、SOPMA、DANMAN、MEGA6和Prot Fun對推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行分析!窘Y(jié)果】克隆到Pt S16-RNase基因和Pt S17-RNase基因,2者均屬于RNase T2基因家族,與其他多種植物的S-RNase基因的序列相似度為83%~98%,序列均具有S-RNas蛋白典型結(jié)構(gòu)。Pt S16-RNase基因ORF長690 bp,編碼229個氨基酸,Pt S17-RNase基因ORF長678 bp,編碼225個氨基酸。預(yù)測2個S-RNase蛋白均為親水性、不穩(wěn)定的分泌蛋白,二級結(jié)構(gòu)均以α-螺旋、延伸鏈和無規(guī)卷曲為主,在薔薇科李屬植物中具有較高的系統(tǒng)進(jìn)化一致性,可能的主要功能為水解酶和激素!窘Y(jié)論】獲得2個新疆野扁桃自交不親和性花柱特異性決定因子編碼基因S-RNase全長序列。
【作者單位】: 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)與園藝學(xué)院·新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)果樹學(xué)新疆特色果樹研究中心;中國林業(yè)科學(xué)院新疆分院;
【關(guān)鍵詞】: 野扁桃 自交不親和性 S-RNase基因 生物信息學(xué) RACE
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31260465) 國家林業(yè)公益性行業(yè)科研專項(201304701-1,201304701-5) 新疆維吾爾自治區(qū)科技計劃項目(201130102-1-5) 新疆維吾爾自治區(qū)果樹學(xué)重點學(xué)科(201007)
【分類號】:S662.9
【正文快照】: 2新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,烏魯木齊830052;3中國林業(yè)科學(xué)院新疆分院,烏魯木齊830000)and location of signal peptide cleavage sites of the deduced amino acid sequences were predicted by Sig-nal P 4.1 Server.The subcellular location of the deduced amino acid sequence
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號:810675
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