βB2基因敲除小鼠睪丸組織長鏈非編碼RNA的差異性表達分析
本文關鍵詞:βB2基因敲除小鼠睪丸組織長鏈非編碼RNA的差異性表達分析
更多相關文章: lncRNA βB晶體蛋白 睪丸發(fā)育 Prx
【摘要】:目的探討長鏈非編碼RNA(lncRNA)在βB2基因敲除小鼠睪丸中的表達及其影響睪丸發(fā)育的可能機制。方法采用lncRNA芯片技術(shù),篩選野生型(WT)和βB2基因敲除(KO)小鼠睪丸組織(均n=3)中l(wèi)ncRNA及信使RNA(mRNA)表達譜的變化;對差異表達lncRNA和mRNA進行GO數(shù)據(jù)庫分析及KEGG數(shù)據(jù)庫分析,建立調(diào)控網(wǎng)絡圖;采用實時熒光定量PCR(qRT-PCR)驗證差異表達的lncRNA和mRNA,探討調(diào)控通路。結(jié)果 (1)兩組小鼠睪丸組織差異表達的lncRNA共140條,mRNA共477條;(2)通過GO數(shù)據(jù)庫分析,篩選出差異表達lncRNA共12條,其中上調(diào)7條,下調(diào)5條;(3)經(jīng)KEGG數(shù)據(jù)庫進行路徑分析,發(fā)現(xiàn)差異表達mRNA主要經(jīng)由Ca2+信號、配體-受體相互作用等信號通路起作用;(4)用關聯(lián)矩陣法建立了lncRNA和mRNA共表達網(wǎng)絡圖,共有17個節(jié)點,12條連接,包含9條lncRNA和8條mRNA;其中Rsl1由3條lncRNA調(diào)控,Lpo和Mpo各由2條lncRNA調(diào)控,Hdac1、Ephb4等各由1條lncRNA調(diào)控。(5)qRT-PCR分析結(jié)果表明,在βB2基因敲除小鼠睪丸組織中,lncRNA A-30-P01019163和P2rx7的表達均下調(diào)(P0.05)。結(jié)論 lncRNA與βB2基因的晶狀體外功能密切相關,其中l(wèi)ncRNA A-30-P01019163可能通過調(diào)控下游P2rx7mRNA的表達影響睪丸組織細胞周期及信號轉(zhuǎn)導,進而調(diào)控睪丸發(fā)育。
【作者單位】: 第二軍醫(yī)大學長海醫(yī)院實驗診斷科;第二軍醫(yī)大學長海醫(yī)院婦產(chǎn)科;
【關鍵詞】: lncRNA βB晶體蛋白 睪丸發(fā)育 Prx
【基金】:國家自然科學基金(81170834,81571387,81300748)~~
【分類號】:R339.21
【正文快照】: [Acad J Sec Mil Med Univ,2016,37(1):59-64]βB2晶體蛋白(βB2crystallin,CRYBB2)主要在晶狀體表達,對維持晶狀體的屈光度及透明性起重要作用。有研究發(fā)現(xiàn)βB2基因敲除(KO)會引起年齡相關性白內(nèi)障的發(fā)生[1]。除了晶狀體外,CRYBB2還能在晶狀體外表達并具有重要功能,如可在視
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