本文關(guān)鍵詞：陸地棉EPSPS基因全基因組分析

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【摘要】：當(dāng)前在NCBI中提交的來(lái)源于陸地棉的EPSPS基因有2個(gè),隨著陸地棉基因組測(cè)序結(jié)果的公布,為在陸地棉基因組中全面鑒定EPSPS基因的存在提供了便利條件。從陸地棉異源四倍體標(biāo)準(zhǔn)系TM-1基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中共搜尋獲得4個(gè)EPSPS同源基因,這4個(gè)基因分別分布在A07、A12、D07和D12亞基因組。從這4個(gè)基因的核苷酸序列、氨基酸序列和基因結(jié)構(gòu)的比對(duì),構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的系統(tǒng)發(fā)育分析以及基因的轉(zhuǎn)錄情況研究來(lái)看,定位在A07和D07亞基因組的2個(gè)基因?qū)儆诠簿�(xiàn)性高度同源基因,定位在A12和D12亞基因組的2個(gè)基因也是相同的情況。序列比對(duì)結(jié)果表明,已經(jīng)在NCBI中提交的2個(gè)EPSPS基因分別是定位在A12和D12亞基因組上的基因,研究結(jié)果為定位在A07和D07亞基因組上EPSPS基因的克隆和功能研究提供了基礎(chǔ)理論依據(jù)。
【作者單位】： 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)部長(zhǎng)江下游棉花和油菜重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 陸地棉 陸地棉基因組 EPSPS基因
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31301682) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新基金項(xiàng)目(CX(14)5009) 國(guó)家轉(zhuǎn)基因重大專(zhuān)項(xiàng)(2013ZX08005)
【分類(lèi)號(hào)】：S562
【正文快照】： 在植物、藻類(lèi)、真菌、細(xì)菌和頂配位寄生蟲(chóng)體內(nèi)存在一條和芳香族氨基酸生物合成相關(guān)的代謝途徑—莽草酸途徑(Shikimate pathway),該途徑起始于五碳糖磷酸途徑中間產(chǎn)物赤蘚糖-4-磷酸(Erythrose 4-phosphate)和糖酵解中間產(chǎn)物磷酸烯醇式丙酮酸(Phosphoenolpyruvate,PEP),終產(chǎn)物是

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1 孫傳波;李海華;郭嘉;陶蕊;曲文利;孟凡梅;張舉仁;劉文國(guó);袁英;;農(nóng)桿菌介導(dǎo)法向玉米莖尖導(dǎo)入抗草甘膦EPSPS基因的研究[J];生物技術(shù)通報(bào);2011年03期

2 龔元亞;代其林;楊娟;鮮先毅;孫英坤;謝琳;王勁;;用根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)EPSPS基因遺傳轉(zhuǎn)化擬南芥的研究[J];吉林農(nóng)業(yè);2011年04期

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4 陳豐;轉(zhuǎn)EPSPS基因抗除草劑大豆對(duì)土壤固氮菌群影響的研究[D];南京大學(xué);2012年

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本文編號(hào)：802796