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煙草抗番茄斑萎病毒基因篩選與生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2017-09-03 02:04

  本文關(guān)鍵詞:煙草抗番茄斑萎病毒基因篩選與生物信息學(xué)分析


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【摘要】:通過(guò)同源克隆的方法在TSWV高感煙草品種NC89、TSWV耐病煙草品種中煙100中分別克隆出一個(gè)疑似抗番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)的基因,分別命名為NtSw-5~(NC89)和NtSw-5~(zy100)。序列分析表明,NtSw-5~(NC89)長(zhǎng)3819bp,包含1個(gè)完整的讀碼框,編碼1273個(gè)氨基酸,理論等電點(diǎn)和相對(duì)分子質(zhì)量分別為5.64和147529.5Da;NtSw-5~(zy100)長(zhǎng)3165bp,包含1個(gè)完整的讀碼框,編碼1054個(gè)氨基酸,理論等電點(diǎn)和相對(duì)分子質(zhì)量分別為6.75和122032.9Da;NtSw-5~(NC89)和NtSw-5~(zy100)均不含信號(hào)肽,均無(wú)明顯跨膜區(qū),二者均含有大多數(shù)植物抗性蛋白所共有的CC-(NB-ARC)-LRR典型結(jié)構(gòu)。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,NtSw-5~(NC89)與馬鈴薯假定晚疫病抗性蛋白同源R1A-3近源關(guān)系最近,NtSw-5~(zy100)與煙草假定晚疫病抗性蛋白同源R1A-3同型X2近源關(guān)系最近。該結(jié)果可為煙草番茄斑萎病毒抗性研究和煙草番茄斑萎病毒的防治提供理論基礎(chǔ)。
【作者單位】: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院煙草研究所煙草行業(yè)煙草病蟲(chóng)害監(jiān)測(cè)與綜合治理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;北京科技大學(xué)化學(xué)與生物工程學(xué)院;甘肅省煙草公司慶陽(yáng)市公司;云南煙草保山香料煙有限責(zé)任公司;
【關(guān)鍵詞】煙草 番茄斑萎病毒 抗性基因 生物信息學(xué)分析
【基金】:國(guó)家煙草專賣局科技創(chuàng)新平臺(tái)項(xiàng)目“煙草行業(yè)煙草病蟲(chóng)害監(jiān)測(cè)與綜合治理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室專項(xiàng)經(jīng)費(fèi)”(023201305) 云南省煙草公司科技項(xiàng)目“德宏綠色生態(tài)優(yōu)質(zhì)煙葉生產(chǎn)技術(shù)研究及應(yīng)用”(2013YN37)
【分類號(hào)】:S435.72
【正文快照】: 近年來(lái),隨著農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)的調(diào)整以及全球農(nóng)副產(chǎn)品貿(mào)易的頻繁,造成眾多植物病毒及其媒介昆蟲(chóng)的全球傳播和蔓延。番茄斑萎病毒(Tomatospotted wilt virus,TSWV)正是在這種情況下,隨其蟲(chóng)媒介體薊馬(Thrip)進(jìn)入我國(guó),在我國(guó)煙草種植區(qū)猖獗危害[1]。種植抗病品種是防治番茄斑萎病最

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

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2 邱樹(shù)亮;王孝宣;杜永臣;高建昌;國(guó)艷梅;朱德蔚;胡鴻;李寶聚;石延霞;;番茄斑萎病毒TSWV的鑒定及抗病種質(zhì)的篩選[J];園藝學(xué)報(bào);2012年06期

3 李丞;李永忠;文國(guó)松;劉雅婷;;煙草番茄斑萎病的研究進(jìn)展[J];中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào);2007年02期

【共引文獻(xiàn)】

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2 莫云容;鮑繼艷;朱海山;趙凱;;番茄抗番茄斑萎病毒病育種研究進(jìn)展[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué));2016年04期

3 張輝;田守波;朱龍英;萬(wàn)延慧;劉娜;楊學(xué)東;朱為民;;番茄抗斑萎病毒(TSWV)育種進(jìn)展[J];江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2016年04期

4 莫云容;張培欣;鄧明華;楊正安;朱海山;張宏;湯曉倩;文玲;馬仲飛;趙凱;;番茄自交系YNAU335對(duì)番茄斑萎病毒抗性的鑒定[J];中國(guó)蔬菜;2016年05期

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6 盧小雨;林偉;張偉鋒;徐浪;鄭耘;余道堅(jiān);;介體薊馬傳播番茄斑萎病毒能力的研究進(jìn)展[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);2016年06期

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8 吳興海;陳長(zhǎng)法;余冬冬;王英超;封立平;王亞茹;;番茄斑萎病毒N基因克隆及其植物表達(dá)載體的構(gòu)建[J];食品安全質(zhì)量檢測(cè)學(xué)報(bào);2014年12期

9 李秋芳;智龍;李穆;徐燁;黃亞寧;劉雅婷;;云南鳶尾上發(fā)現(xiàn)番茄環(huán)紋斑點(diǎn)病毒[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué));2014年02期

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 方琦;董家紅;丁銘;尹躍艷;張麗珍;李婷婷;蘇曉霞;李展;張仲凱;;侵染水鬼蕉和花朱頂紅的番茄斑萎病毒屬病毒的電鏡和DAS-ELISA診斷[J];園藝學(xué)報(bào);2011年10期

2 楊帆;劉萬(wàn)學(xué);張國(guó)安;萬(wàn)方浩;;西花薊馬傳播番茄斑萎病毒研究進(jìn)展[J];環(huán)境昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);2011年02期

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7 陳坤榮,許澤永,晏立英,王國(guó)平;番茄斑萎病毒屬(Tospovirus)病毒研究進(jìn)展[J];中國(guó)油料作物學(xué)報(bào);2005年03期

8 張仲凱,丁銘,方琦,張麗珍,李婷婷,彭潞波,蘇曉霞,李展;番茄斑萎病毒屬(Tospovirus)病毒在云南的發(fā)生分布研究初報(bào)[J];西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2004年S1期

9 丁銘,張麗珍,方琦,李婷婷,蘇曉霞,李展,張仲凱;侵染馬鈴薯的一個(gè)Tospovirus混合分離物的鑒定、純化及多抗血清制備[J];西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2004年S1期

10 張仲凱,楊錄明,方琦,彭潞波,汪繼玲,普耀芳;番茄斑萎病毒侵染煙草的細(xì)胞病理[J];電子顯微學(xué)報(bào);2004年04期

【相似文獻(xiàn)】

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1 明德南;;番茄斑萎病毒及其傳播[J];世界熱帶農(nóng)業(yè)信息;2008年05期

2 習(xí)鳳妮;譚新球;朱春暉;孫書(shū)娥;張德詠;劉勇;;番茄斑萎病毒檢測(cè)技術(shù)發(fā)展趨勢(shì)概述[J];湖南農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年05期

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5 李飛;吳青君;徐寶云;謝文;王少麗;張友軍;;北京地區(qū)發(fā)現(xiàn)番茄斑萎病毒[J];植物保護(hù);2012年06期

6 姚革;;四川曬煙上發(fā)現(xiàn)番茄斑萎病毒[J];煙草科技;1992年06期

7 尼秀媚;陳長(zhǎng)法;封立平;吳興海;徐瓊;;番茄斑萎病毒研究進(jìn)展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年19期

8 張仲凱,楊錄明,方琦,彭潞波,汪繼玲,普耀芳;番茄斑萎病毒侵染煙草的細(xì)胞病理[J];電子顯微學(xué)報(bào);2004年04期

9 唐前君;孫書(shū)娥;劉勇;譚新球;肖啟明;謝丙炎;張德詠;;番茄斑萎病毒核衣殼蛋白基因的克隆與分析[J];植物保護(hù);2010年05期

10 劉雅婷;鄭元仙;李永忠;徐小剛;孫文濤;李正躍;;番茄斑萎病毒在煙草植株上癥狀學(xué)特征[J];中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào);2009年19期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

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3 張仲凱;楊錄明;方琦;彭潞波;汪繼玲;普耀芳;;番茄斑萎病毒侵染煙草的細(xì)胞病理[A];第十三屆全國(guó)電子顯微學(xué)會(huì)議論文集[C];2004年

4 尹躍艷;董家紅;丁銘;方琦;張仲凱;;云南番茄斑萎病毒不同分離物的遺傳進(jìn)化分析[A];中國(guó)植物病理學(xué)會(huì)2011年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2011年

5 張仲凱;方琦;董家紅;丁銘;李婷婷;蘇曉霞;;番茄斑萎病毒侵染引起寄主細(xì)胞的質(zhì)壁分離[A];2005年全國(guó)電子顯微學(xué)會(huì)議論文集[C];2005年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 ;番茄斑萎病毒和鳳仙花葉病毒的控制[N];中國(guó)花卉報(bào);2003年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 孫書(shū)娥;番茄斑萎病毒的分離鑒定及表達(dá)dsRNA的轉(zhuǎn)基因煙草的抗病性研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 趙永發(fā);抗番茄斑萎病毒物質(zhì)篩選及作用機(jī)制初步研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

2 習(xí)鳳妮;番茄斑萎病毒實(shí)時(shí)熒光定量PCR快速檢測(cè)方法的建立[D];中南大學(xué);2013年

3 尚衛(wèi)娜;番茄斑萎病毒和番茄環(huán)紋斑點(diǎn)病毒細(xì)胞病理學(xué)及其運(yùn)動(dòng)蛋白的研究[D];浙江大學(xué);2012年

4 孫書(shū)娥;番茄斑萎病毒(TSWV)dsRNA介導(dǎo)的分子免疫調(diào)控作用研究[D];中南大學(xué);2010年

5 林授鍇;進(jìn)境臺(tái)灣十字花科蔬菜有害生物風(fēng)險(xiǎn)分析及番茄斑萎病毒快速檢測(cè)方法研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2008年

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本文編號(hào):782189

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