本文關(guān)鍵詞：基于線粒體COII-LrRNA基因?qū)δI形腎狀線蟲種內(nèi)群體的遺傳多樣性分析

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【摘要】：腎形腎狀線蟲(Rotylenchulus reniformis)是一種植物半內(nèi)寄生線蟲,分布于世界的熱帶和亞熱帶地區(qū),是許多蔬菜和熱帶果樹重要的病原線蟲。為明確該線蟲種內(nèi)群體的遺傳變異,本研究采用序列分析法,對采自浙江(ZJ)、福建(FJ)和重慶(CQ)3個(gè)地區(qū)的腎形腎狀線蟲的線粒體COII-Lr RNA基因序列進(jìn)行比較。結(jié)果表明,腎形腎狀線蟲線粒體COII-Lr RNA基因片段序列為557~563 bp,AT含量為85.5%,明顯高于GC含量。序列分析所得3個(gè)群體總的變異位點(diǎn)數(shù)、單倍型數(shù)、單倍型多樣性指數(shù)(haplotype diversity,Hd)和核苷酸多樣性指數(shù)(nucleotide diversity,π)分別為176、40、0.946和0.157 4。分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)結(jié)果顯示,這3個(gè)腎形腎狀線蟲群體間遺傳分化系數(shù)為0.058 15,遺傳分化程度中等,沒有明顯的地理隔離。遺傳變異結(jié)果顯示,94.18%的變異來自群體內(nèi)個(gè)體間,只有5.82%的變異發(fā)生在群體間。結(jié)果說明,我國腎形腎狀線蟲種群內(nèi)COII-Lr RNA基因序列變異較明顯,具有豐富的遺傳多樣性,且對環(huán)境變化的適應(yīng)能力較強(qiáng)。研究結(jié)果豐富了我國腎形腎狀線蟲的系統(tǒng)發(fā)育信息,為腎形腎狀線蟲危害植物的內(nèi)在遺傳因素的研究提供了資料。
【作者單位】： 浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院生物技術(shù)研究所;蘇州出入境檢驗(yàn)檢疫局;
【關(guān)鍵詞】： 腎形腎狀線蟲 線粒體DNA(mtDNA) COII-LrRNA基因 遺傳多樣性
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.31371921) 國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)(No.2013CB127501)
【分類號(hào)】：S432.45
【正文快照】： 腎形線蟲屬(Rotylenchulus)是一種植物半內(nèi)寄生線蟲,通常分布于熱帶和亞熱帶地區(qū),目前屬內(nèi)有10個(gè)有效種,而國內(nèi)已報(bào)道的有腎形腎狀線蟲(R.reniformis)和北方貝腎狀線蟲(R.borealis)兩種(張燕,2010)。腎形腎狀線蟲是其中分布和危害最廣泛的一種,其寄主植物多達(dá)300余種,主要包括

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