本文關(guān)鍵詞：腫瘤相關(guān)hsa-miR-95-3p的靶基因預(yù)測(cè)及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：[目的]對(duì)腫瘤相關(guān)hsa-miR-95-3p進(jìn)行靶基因的預(yù)測(cè)及功能分析,為腫瘤發(fā)生的分子機(jī)制提供理論依據(jù)。[方法]選擇miRanda、Target Scan、RNAhybrid 3種軟件預(yù)測(cè)其靶基因,選擇已經(jīng)實(shí)驗(yàn)證實(shí)的靶基因作為進(jìn)一步生物信息學(xué)分析的基因集合,對(duì)此基因集合進(jìn)行功能富集分析(GO分析)、Pathway分析和蛋白互作分析。[結(jié)果]Hsa-miR-95-3p序列在各物種間高度保守。3個(gè)軟件分別預(yù)測(cè)得到2118、1632和58個(gè)靶基因,鑒定得到實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的靶基因共114個(gè),對(duì)這些靶基因進(jìn)行GO和KEGG富集分析。這些靶基因主要富集于蛋白激酶反應(yīng)、基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)、細(xì)胞分裂等生物學(xué)過(guò)程和功能上(P0.05)。信號(hào)通路富集分析顯示富集于AMPK信號(hào)通路,mTOR信號(hào)通路,p53信號(hào)通路,核黃素代謝,肝細(xì)胞癌,非小細(xì)胞肺癌,甲狀腺癌,RNA降解等通路(P0.05)。[結(jié)論]Hsa-miR-95-3p的靶基因主要與腫瘤細(xì)胞的增殖與分化即癌癥發(fā)生的生物學(xué)過(guò)程相關(guān),這為進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)研究提供了線索。
【作者單位】： 浙江省腫瘤醫(yī)院;
【關(guān)鍵詞】： hsa-miR--p 腫瘤 生物信息學(xué) 靶基因
【基金】：浙江中醫(yī)藥管理局一般項(xiàng)目(2016ZB026)
【分類號(hào)】：R730.2
【正文快照】： 腫瘤是機(jī)體在各種致癌因素作用下,局部組織的某一個(gè)細(xì)胞在基因水平上失去對(duì)其生長(zhǎng)的正常調(diào) 控,導(dǎo)致其克隆體異常增生而形成的異常病變。近年來(lái)腫瘤的發(fā)病率及死亡率逐漸增高。以肝癌為例,由于大多數(shù)肝癌都伴有功能性和器質(zhì)性改變?nèi)绺斡不⒏窝�、肝功能損害,其并發(fā)癥往往是肝

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本文編號(hào)：738999