本文關(guān)鍵詞：甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：D14是一類能夠有效抑制水稻分蘗的水解酯酶,可能是獨(dú)腳金內(nèi)酯信號(hào)傳導(dǎo)途徑中的重要組分。為研究該基因在甘蔗分蘗性狀中的功能,利用RT-PCR和RACE技術(shù)從甘蔗主栽品種ROC22中克隆出D14同源基因的c DNA全長(zhǎng),命名為Sc HTD2,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:Sc HTD2基因的c DNA全長(zhǎng)為1 302 bp(KP137674.1),具有927 bp的開(kāi)放閱讀框,編碼308個(gè)氨基酸;蛋白質(zhì)分析表明,Sc HTD2為不穩(wěn)定的水溶性非分泌蛋白,主要作用于氨基酸的生物合成或者作為生長(zhǎng)因子調(diào)控生物生長(zhǎng)發(fā)育。亞細(xì)胞定位于葉綠體,存在14個(gè)磷酸化位點(diǎn),不存在乙�；稽c(diǎn)和信號(hào)肽。二級(jí)結(jié)構(gòu)以α螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲為主,還有一些殘基形成β-折疊和鏈延伸。保守結(jié)構(gòu)域和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)均表明該蛋白包含一個(gè)α保守水解酶家族,屬"D14-Like"或者"DAD2-Like"蛋白家族。推測(cè)Sc HTD2可能作為獨(dú)腳金內(nèi)酯調(diào)控甘蔗分蘗信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中一個(gè)具有催化特性的水解脂酶而起作用。進(jìn)化樹(shù)分析表明該蛋白與高粱、玉米等單子葉植物進(jìn)化關(guān)系較近。
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院;云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所云南省甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 甘蔗 獨(dú)腳金內(nèi)酯 ScHTD 克隆 生物信息學(xué)分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31360359) 云南省中青年學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人后備人才(No.2014HB038) 云南省應(yīng)用基礎(chǔ)研究計(jì)劃青年項(xiàng)目(No.2015FD063)
【分類號(hào)】：S566.1
【正文快照】： 中國(guó)食糖生產(chǎn)主要依靠甘蔗和甜菜作為原料,其中甘蔗糖占據(jù)了整個(gè)食糖產(chǎn)量的90%以上。甘蔗品種以有效莖作為收獲產(chǎn)品,有效莖粗大而多是高產(chǎn)的重要指標(biāo),而大莖高產(chǎn)的關(guān)鍵則是在其分蘗期控制好分蘗芽的萌發(fā)[1]。分蘗芽的萌發(fā),受多種因素控制,如環(huán)境、水肥、生長(zhǎng)階段,內(nèi)部調(diào)控因子

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 葉燕萍;乙烯利促進(jìn)甘蔗有效分蘗的生理生化機(jī)理研究[D];廣西大學(xué);2006年

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 吳轉(zhuǎn)娣;劉新龍;劉家勇;昝逢剛;趙培方;林秀琴;陳學(xué)寬;蘇火生;劉洪博;吳才文;;甘蔗獨(dú)腳金內(nèi)酯生物合成基因ScCCD8的克隆與表達(dá)分析[J];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué);2016年14期

2 呂愛(ài)麗;李旭娟;劉洪博;吳才文;曾千春;劉新龍;;甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J];熱帶作物學(xué)報(bào);2016年06期

3 黃文曉;翁飛;g，

本文編號(hào)：734873