蓖麻RcNHX2基因克隆與生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2017-08-24 13:16
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【摘要】:液泡膜型鈉氫逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(Tonoplast Na~+/H~+antiporters,NHX)在植物耐鹽方面具有重要意義。本研究利用RACE方法克隆了蓖麻Rc NHX2基因的3'端和5'端片段。最后設(shè)計全長引物獲得蓖麻Rc NHX2全長序列,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,蓖麻液泡膜型鈉氫逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的c DNA完整的開放閱讀框序列為1 626 bp,推測其可編碼541個氨基酸;含有典型的液泡膜型鈉氫逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白典型的Na~+/H~+交換泵(~(50)NES~(52))和氨氯吡嗪咪的結(jié)合位點(~(84)LFFIYLLPPI~(93));存在12個跨膜結(jié)構(gòu)域,屬于跨膜蛋白;預(yù)測其定位于細(xì)胞質(zhì)膜和液泡膜及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜。
【作者單位】: 內(nèi)蒙古民族大學(xué)農(nóng)學(xué)院;內(nèi)蒙古民族大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;內(nèi)蒙古自治區(qū)高校蓖麻產(chǎn)業(yè)工程技術(shù)研究中心內(nèi)蒙古自治區(qū)蓖麻育種重點實驗室內(nèi)蒙古自治區(qū)蓖麻產(chǎn)業(yè)協(xié)同創(chuàng)新培育中心;
【關(guān)鍵詞】: 蓖麻 液泡膜型鈉氫逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 基因克隆 生物信息學(xué)分析
【基金】:國家自然基金項目(31260336) 內(nèi)蒙古高校蓖麻產(chǎn)業(yè)工程技術(shù)中心項目(BMYJ2011007) 內(nèi)蒙古自治區(qū)高校蓖麻產(chǎn)業(yè)工程技術(shù)研究中心與軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所合作項目(MV-201201-1)共同資助
【分類號】:S565.6;Q943.2
【正文快照】: *通訊作者,zhangjixing@imun.edu.cnCloning and Bioinformatic Analysis of Rc NHX2 Gene in Castor(Ricinuscommunis L.)Feng Zizhou1Geng Xuejun2Li Ping2Zhang Jixing2,3*Chen Yongsheng2,3*Huo Hongyan2Ji Zhaojun2Musha Moli2,3Cong Jiaojiao2Li Huigen21 College of Ag
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1 J. Michaell Lord;迎春;;植物細(xì)胞毒素凝集素[J];長沙水電師院學(xué)報(自然科學(xué)版);1988年03期
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1 張德剛;周磊;劉艷紅;李春燕;;云南個舊錫礦廢棄地野生蓖麻重金屬富集特征[A];十一五農(nóng)業(yè)環(huán)境研究回顧與展望——第四屆全國農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2011年
,本文編號:731496
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