應(yīng)用基因芯片篩選伊馬替尼和尼洛替尼處理K562細(xì)胞表達(dá)差異基因
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更多相關(guān)文章: 慢性粒細(xì)胞白血病 尼洛替尼 伊馬替尼 基因芯片
【摘要】:目的:探討兩種酪氨酸激酶抑制劑(TKIs)處理K562細(xì)胞的基因表達(dá)譜變化,為認(rèn)識(shí)慢性粒細(xì)胞白血病(CML)的發(fā)病機(jī)制、耐藥機(jī)制提供新的思路,同時(shí)也為治療尋找潛在重要靶標(biāo)分子。方法:利用GEO數(shù)據(jù)庫下載慢性粒細(xì)胞細(xì)胞系(K562)基因表達(dá)芯片數(shù)據(jù),通過差異基因的篩選,趨勢分析、GO分析,信號(hào)通路分析,最后獲得的重要差異表達(dá)核心基因,并建立相互作用網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果:獲得顯著表達(dá)差異基因1000,通過趨勢分析、功能富集分析及信號(hào)通路分析提示主要涉及到代謝途徑、細(xì)胞凋亡、癌癥的途徑、細(xì)胞周期、p53信號(hào)通路。相互作用網(wǎng)絡(luò)分析及同表達(dá)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析,得到重要的核心節(jié)點(diǎn)基因:AK2、ADSL、PKLR、PKM、SHMT2、ATIC、LDHA、ENO1、CTH、GOT1;YARS、CYP3A5、CTH、GYPA、ALAS2、MTHFD2、BLVRB、GUK1、CTSH、LMO2。結(jié)論:利用生物信息學(xué)的方法,分析慢性粒細(xì)胞白血病細(xì)胞基因芯片得到參與不同TKIs處理K562細(xì)胞的重要的細(xì)胞功能及信號(hào)通路主要涉及代謝通路及增殖凋亡信號(hào)途徑,并且尋找到核心節(jié)點(diǎn)基因,為認(rèn)識(shí)K562的耐藥機(jī)制及治療靶點(diǎn)提供新的思路。
【作者單位】: 解放軍第四十四醫(yī)院血液科;第四軍醫(yī)大學(xué)唐都醫(yī)院血液科;
【關(guān)鍵詞】: 慢性粒細(xì)胞白血病 尼洛替尼 伊馬替尼 基因芯片
【基金】:貴州省衛(wèi)生計(jì)生委科學(xué)技術(shù)基金項(xiàng)目(gzwjkj2014-1-058)
【分類號(hào)】:R733.72
【正文快照】: 前言 慢性髓性白血病(CML)是一種惡性造血干細(xì)胞疾病,其臨床特點(diǎn)是染色體9和22之間的易位,BCR-ABL酪氨酸激酶抑制劑伊馬替尼已成為新診斷的慢性粒細(xì)胞白血病首選治療手段[1]。尼洛替尼是具有較高效能一個(gè)衍生物(二代TKI),在部分伊馬替尼耐藥的患者會(huì)選擇使用[2],BCR-ABL突變
【相似文獻(xiàn)】
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5 羅依;譚亞敏;韓曉雁;朱曉黎;鄭偉燕;謝萬灼;張潔;葉t摻,
本文編號(hào):725267
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