綿羊生長候選基因克隆與組織表達(dá)及其SNPs與生長性狀關(guān)聯(lián)分析
本文關(guān)鍵詞:綿羊生長候選基因克隆與組織表達(dá)及其SNPs與生長性狀關(guān)聯(lián)分析
更多相關(guān)文章: 綿羊 SPP1 LAP3 LCORL 生長性狀 基因表達(dá) SNPs 關(guān)聯(lián)分析
【摘要】:本研究以綿羊6號染色體36.15~38.56 Mb區(qū)域內(nèi)與生長相關(guān)的分泌性磷酸化蛋白基因(Secreted phosphoprotein 1,SPP1)、亮氨酸氨基肽酶基因(Leucine aminopeptidase 3,LAP3)和配體依賴的核受體輔阻遏物基因(Ligand dependent nuclear receptor corepressor like,LCORL)為目的基因,克隆了其完整或部分編碼區(qū)序列,研究了其組織表達(dá)規(guī)律,并對其編碼區(qū)SNPs與生長性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)性分析。結(jié)果如下:(1)克隆得到了綿羊SPP1基因完整編碼區(qū)序列、綿羊LAP3基因和綿羊LCORL基因的部分編碼區(qū)序列,長度分別為1122 bp、567 bp和1543 bp;預(yù)測綿羊SPP1基因編碼產(chǎn)物可能作為一種分泌蛋白參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄調(diào)控等生物學(xué)過程;綿羊LAP3基因可能參與信號傳導(dǎo)、脅迫應(yīng)答和轉(zhuǎn)錄調(diào)控等生物學(xué)過程;綿羊LCORL基因可能參與轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄調(diào)控等生物學(xué)過程。(2)綿羊SPP1、LAP3和LCORL基因在所研究的12種組織中均有表達(dá),屬廣譜表達(dá)基因,SPP1和LAP3基因分別在中樞神經(jīng)和十二指腸中表達(dá)量最高,LCORL基因在十二指腸和肺中表達(dá)量較高。(3)運(yùn)用測序和PCR-RFLP的方法對綿羊SPP1、LAP3和LCORL基因編碼區(qū)進(jìn)行了SNPs掃描及其與生長性狀關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明,綿羊SPP1基因中存在c.132AC突變位點(diǎn),性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明該突變位點(diǎn)與初生重和周歲重顯著相關(guān)(P0.05),C等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因。LAP3基因中存在c.187 CG和c.1116 CT突變位點(diǎn),其中c.187 CG突變位點(diǎn)與初生重、1月齡重和3月齡重呈顯著相關(guān)(P0.05),與2月齡重呈極顯著相關(guān)(P0.01);c.1116 CT突變位點(diǎn)與初生重呈極顯著相關(guān)(P0.01),與1月齡重和2月齡重呈顯著相關(guān)(P0.05);上述2個突變位點(diǎn)為C等位基因個體體重顯著增大,CC型初生重、1月齡重和斷奶重呈顯著高于GG型(P0.05),C等位基因?yàn)閮?yōu)勢等位基因。
【關(guān)鍵詞】:綿羊 SPP1 LAP3 LCORL 生長性狀 基因表達(dá) SNPs 關(guān)聯(lián)分析
【學(xué)位授予單位】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S826
【目錄】:
- 摘要4-5
- Summary5-7
- 縮寫詞中英文對照表7-9
- 第一章 文獻(xiàn)綜述9-16
- 1 綿羊生長性狀相關(guān)基因的研究進(jìn)展9-13
- 1.1 GH基因的研究進(jìn)展9-11
- 1.2 MSTN基因的研究進(jìn)展11-12
- 1.3 Callipyge基因的研究進(jìn)展12-13
- 2 與本研究相關(guān)基因的研究進(jìn)展13-16
- 2.1 SPP1基因的研究進(jìn)展13-14
- 2.2 LAP3基因的研究進(jìn)展14-15
- 2.3 LCORL基因的研究進(jìn)展15-16
- 第二章 試驗(yàn)研究16-63
- 1 試驗(yàn)材料與方法16-26
- 1.1 試驗(yàn)材料16-19
- 1.2 方法19-26
- 2 結(jié)果與分析26-57
- 2.1 綿羊SPP1、LAP3和LCORL基因的克隆及生物信息學(xué)分析26-44
- 2.2 綿羊SPP1、LAP3和LCORL基因的組織表達(dá)譜分析44-48
- 2.3 SPP1、LAP3和LCORL基因的SNPs檢測及與體重的關(guān)聯(lián)性48-57
- 3 討論57-61
- 3.1 關(guān)于利用基因組數(shù)據(jù)庫來克隆新基因57
- 3.2 關(guān)于綿羊SPP1、LAP3和LCORL基因的生物信息學(xué)分析57-59
- 3.3 關(guān)于綿羊SPP1、LAP3和LCORL基因表達(dá)59-60
- 3.4 關(guān)于基因的SNPs掃描與性狀關(guān)聯(lián)分析60-61
- 4 小結(jié)61-63
- 4.1 本研究獲得的結(jié)果61
- 4.2 本研究的創(chuàng)新點(diǎn)與特色61-62
- 4.3 本研究的不足之處及進(jìn)一步值得研究的工作62-63
- 參考文獻(xiàn)63-72
- 致謝72-73
- 個人簡介73-74
- 導(dǎo)師簡介74-75
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號:719714
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