浙江紅肉柚類胡蘿卜素合成酶基因片段的SNP分析
發(fā)布時間:2017-08-17 19:53
本文關(guān)鍵詞:浙江紅肉柚類胡蘿卜素合成酶基因片段的SNP分析
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【摘要】:【目的】對浙江紅肉柚類資源進行遺傳多樣性分析,為其搜集保護和合理利用提供理論依據(jù)。【方法】采用RTPCR技術(shù)從11份浙江紅肉柚類資源中克隆6個類胡蘿卜素合成主鏈上的關(guān)鍵酶基因片段,分析所得基因片段中的SNP位點,對浙江紅肉柚類資源的遺傳多樣性進行精確研究!窘Y(jié)果】在11份供試材料中克隆到的八氫番茄紅素合成酶(PSY)、八氫番茄紅素脫氫酶(PDS)、ζ-胡蘿卜素脫氫酶(ZDS)、番茄紅素β環(huán)化酶(LBCY)、番茄紅素ε環(huán)化酶(LECY)、β-胡蘿卜素羥化酶(BCH)的基因片段長度分別為348、521、426、429、403、459 bp,其中PSY、ZDS、LBCY、LECY、BCH的基因序列在供試材料中分別有2、12、2、1、1個單核苷酸位點發(fā)生變異,多態(tài)性頻率分別為1 SNP/174 bp、1 SNP/43.3 bp、1 SNP/213 bp、1 SNP/403 bp和1 SNP/459 bp,而PDS基因序列在11份供試材料中高度保守,無核苷酸位點變異。利用Mega軟件NJ聚類法對6個基因片段的核苷酸序列進行遺傳多樣性分析顯示,11個樣品聚為3大類群。‘官南紅柚’‘文成紅心柚’‘處紅柚’‘木蘭柚’親緣關(guān)系較近,歸于第一類;‘古磉柚’‘永嘉紅心柚’‘青田紅柚’歸于第二類;‘紅肉蜜柚’‘麻步文旦’‘四季柚’和‘紅心四季柚’歸于第三類!窘Y(jié)論】浙江紅肉柚類資源果肉中類胡蘿卜素合成主鏈上的關(guān)鍵酶基因在編碼區(qū)除PDS外均存在SNP變異,其中ZDS的單核苷酸多態(tài)性頻率較高,PSY、LBCY、LECY和BCH 4個基因片段的SNP變異位點較少,說明類胡蘿卜素生物合成基因在柚品種間總體較為保守,但這些變異可能是導(dǎo)致果肉紅色深淺程度的變因。根據(jù)6個基因片段核苷酸序列的遺傳多樣性分析,‘官南紅柚’、‘文成紅心柚’、‘處紅柚’和‘木蘭柚’,‘古磉柚’‘永嘉紅心柚’和‘青田紅柚’,‘紅肉蜜柚’‘麻步文旦’‘四季柚’和‘紅心四季柚’,分別歸于親緣關(guān)系較近的同一類群。
【作者單位】: 浙江省亞熱帶作物研究所;
【關(guān)鍵詞】: 柚 紅肉 類胡蘿卜素 基因片段 SNP分析
【基金】:浙江省優(yōu)先主題重點農(nóng)業(yè)科研項目(2011C12017) 溫州市科技計劃項目(N20150011、X20150024)
【分類號】:S666.3
【正文快照】: 柑橘植物中汁胞為紅色類型的品種資源較為豐富,如粉紅色的紅肉葡萄柚(Citrus paradisii Macf.)、鮮紅色的‘紅肉蜜柚’(C.gransis L.)、橙紅色的‘紅廣橘’(C.reticulata Blanco)、血紅色的血橙(C.sinensisL.)等,這些紅肉柑橘品種因色澤鮮艷以及特殊的營養(yǎng)價值而深受消費者歡
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1 尹濤;盧虹玉;張上隆;劉敬梅;陳大明;;甜蛋白Brazzein基因在番茄果實中的特異表達[J];遺傳;2009年06期
2 田雪芬;唐曉鳳;李,
本文編號:690791
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