本文關(guān)鍵詞：番茄WRKY基因家族的生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 番茄 WRKY 轉(zhuǎn)錄因子 基因家族 生物信息學(xué)

【摘要】：通過生物信息學(xué)的方法對番茄WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族成員、理化性質(zhì)、基因分類、染色體定位、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系和結(jié)構(gòu)域序列保守性進(jìn)行了預(yù)測。從番茄WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族分類及進(jìn)化結(jié)果顯示,番茄Sl WRKY家族包含81個成員,按其WRKY結(jié)構(gòu)域及鋅指結(jié)構(gòu)分為3族,第二族按其氨基酸順序又可以分為5個亞族。染色體定位結(jié)果顯示,除番茄的11號染色體沒有WRKY轉(zhuǎn)錄因子,其他染色體上均有分布�；蚪Y(jié)構(gòu)分析表明,僅Sl WRKY19、Sl WRKY20家族成員不含內(nèi)含子,其他成員都含有2~5個內(nèi)含子。保守域分析表明,番茄WRKY結(jié)構(gòu)域是高度保守的,僅有10個WRKYGQK發(fā)生了變異,占WRKY家族的10%。
【作者單位】： 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 番茄 WRKY 轉(zhuǎn)錄因子 基因家族 生物信息學(xué)
【基金】：國家科技支撐計劃項目(2012BAD02B02-7) 黑龍江省杰出青年科學(xué)基金(JC201204)共同資助
【分類號】：S641.2
【正文快照】： Bioinformatics Analysis of WRKY Gene Family in TomatoZhang Hong Jiang Jingbing Xu Xiangyang Li Jingfu*College of Horticulture,Northeast Agricultural University,Harbin,150030*Corresponding author,Ljf_2005@126.comWRKY是植物中最大的一類轉(zhuǎn)錄因子家族,該家族蛋

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中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

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本文編號：690207