基因重組型番鴨細小病毒FJM3的全基因組特征
本文關(guān)鍵詞:基因重組型番鴨細小病毒FJM3的全基因組特征
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【摘要】:從1例未免疫雛番鴨細小病毒活疫苗與鵝細小病毒活疫苗的臨床病死雛番鴨臟器中成功分離到1株番鴨細小病毒(FJM3株)。為明確其基因組特征,運用PCR方法,擴增出番鴨細小病毒FJM3株全基因組。結(jié)果表明,FJM3株基因組全長為5017nt,其基因組結(jié)構(gòu)和經(jīng)典番鴨細小病毒參考毒株一致。序列比對結(jié)果表明,FJM3株全基因組序列與GenBank中登錄的經(jīng)典MDPV參考株(FM株)核苷酸序列同源性為94.0%,與番鴨源GPV參考株(Y株)核苷酸序列同源性為85.6%。全基因組遺傳進化分析表明,FJM3株處于MDPV遺傳進化分支;VP1基因遺傳分析表明,FJM3株處于經(jīng)典MDPV遺傳進化分支;VP3遺傳進化表明,FJM3株處于GPV遺傳進化分支。對FJM3株和參考株(FM株、Y株和SYG61v)進行遺傳重組分析表明,該毒株于存在2處MDPV與GPV的基因重組現(xiàn)象。
【作者單位】: 福建省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所福建省畜禽疫病防治工程技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】: 番鴨細小病毒 基因組 重組 序列分析
【基金】:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)體系建設(shè)專項基金資助項目(CARS-43) 公益行業(yè)農(nóng)業(yè)科研專項基金資助項目(201003012) 福建省農(nóng)業(yè)科學院“青年科技英才百人計劃”項目(YC2015-12) 福建省自然科學基金資助項目(2015J01114) 新世紀“百千萬人才工程”國家級人選科研補助基金資助項目(NCNCMTPC-2009)
【分類號】:S852.65
【正文快照】: *Corresponding author,E-mail:huangyu_815@163.com番鴨感染細小病毒病最早由本研究室林世棠等[1]于國內(nèi)外首次報道。主要臨床特征為張口呼吸、腹瀉、胰腺出血或見有白色壞死點、十二指腸黏膜出血,主要侵害3周齡內(nèi)的雛番鴨[2-6]。隨后,番鴨細小病毒病在我國臺灣地區(qū)、法國、
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,本文編號:631486
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