本文關(guān)鍵詞：灰氈毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息學(xué)和表達(dá)分析

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【摘要】：目的基于前期對灰氈毛忍冬Lonicera macranthoides轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果,從灰氈毛忍冬RNA中克隆灰氈毛忍冬MADS-box基因家族蕾期延長相關(guān)基因AGL15,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)及表達(dá)分析。方法對灰氈毛忍冬總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reverse transcription-PCR,RT-PCR)和c DNA末端快速擴(kuò)增反應(yīng)(rapid amplification of c DNA ends,RACE),獲得完整的開放閱讀框(ORF)。運(yùn)用生物信息學(xué)的方法對該序列進(jìn)行同源性分析和相似性比較,預(yù)測編碼蛋白,并對其進(jìn)行各種理化性質(zhì)分析。運(yùn)用半定量PCR測得該基因在灰氈毛忍冬不同部位的表達(dá)情況。結(jié)果獲得AGL15基因,ORF長795 bp,編碼264個(gè)氨基酸,與葡萄Vitis vinifera中MADS-box基因家族AGL15基因相似性最高,且包含MADS和K-box的保守序列。AGL15蛋白無跨膜區(qū)域,定位于細(xì)胞質(zhì)中,在灰氈毛忍冬各部位均有表達(dá)。結(jié)論首次從灰氈毛忍冬中克隆得到可能控制蕾期延長的基因,分析了其在灰氈毛忍冬不同部位表達(dá)差異性,為灰氈毛忍冬蕾期延長研究提供參考。
【作者單位】： 湖南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院;湖南中醫(yī)藥大學(xué);湖南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 灰氈毛忍冬 蕾期延長 基因克隆 生物信息學(xué)分析 基因表達(dá)
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81203007) 湖南省自然科學(xué)基金資助(13JJ9010) 湖南省教育廳科技創(chuàng)新平臺(14K071) 湖南省研究生科研創(chuàng)新項(xiàng)目(CX2014B368) 湖南省“中藥學(xué)”重點(diǎn)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目資助(湘教通[2011]76號:zy201403,zy201505)
【分類號】：S567.19
【正文快照】： 灰氈毛忍冬Lonicera macranthoides Hand.-Mazz.為忍冬科植物。干燥花蕾或帶初開的花為中藥[1],具有清熱解毒,涼散風(fēng)熱的功效,臨床上廣泛用于治療癰腫疔瘡、喉痹、丹毒、熱毒血痢、風(fēng)熱感冒、溫?zé)岚l(fā)病等癥,也可作為提取綠原酸或揮發(fā)油的原料,長期以來如何解決灰氈毛忍冬蕾期短

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本文編號：631470