發(fā)布時間：2017-07-31 17:00

  本文關(guān)鍵詞：人MTERF4基因啟動子的生物信息學(xué)研究

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【摘要】：人線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子4(mitochondrial transcription termination factor 4,MTERF4)基因?qū)儆诰�粒體轉(zhuǎn)錄終止因子基因超家族,其編碼的蛋白質(zhì)是調(diào)控線粒體核糖體生物合成和線粒體蛋白質(zhì)翻譯的重要因子。目前,MTERF4基因自身的表達(dá)調(diào)控機(jī)制仍不清楚。為了探討人MTERF4基因啟動子區(qū)的序列特征和基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,采用進(jìn)化足跡法,利用生物信息學(xué)在線軟件對人MTERF4基因上游5'端的啟動子分布、轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合位點(diǎn)、CpG島進(jìn)行分析。結(jié)果表明,人MTERF4基因上游5'端3 000 bp的核苷酸序列至少存在3個啟動子,其中1 799~2 368 bp之間可能包含核心啟動子。啟動子區(qū)序列中存在1個長為558 bp的CpG島。人和小鼠MTERF4同源基因的啟動子區(qū)有1個保守區(qū)域,存在18個共有的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。通過生物信息學(xué)軟件分析人MTERF4基因啟動子,提高了針對該基因啟動子的研究效率,為后續(xù)實(shí)驗(yàn)深入研究啟動子的功能奠定了重要的理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 大理大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;云南省昆蟲生物醫(yī)藥研發(fā)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子基因(MTERF) 啟動子 CpG島 轉(zhuǎn)錄因子 生物信息學(xué)
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(81560458,31601155) 云南省教育廳科學(xué)研究基金重點(diǎn)項目(2014Z126) 大理大學(xué)博士科研啟動基金項目(BSKY2012018);大理大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)計劃項目(201402)
【分類號】：Q811.4
【正文快照】： 線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子4(mitochondrial transcrip-tion termination factor 4,MTERF4)亦被命名為線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子結(jié)構(gòu)域2(mitochondrial transcrip-tion termination factor domain containing 2,MTER-FD2),該基因歸屬于線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子基因超家族,是通過PSI-BLAST方法鑒

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 況守龍;胡廷章;;啟動子的克隆和研究方法[J];重慶工學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版);2007年01期

2 李志新;曹雙河;張相岐;張懷剛;;偽鵝觀草高分子量麥谷蛋白基因啟動子的克隆[J];長江大學(xué)學(xué)報(自科版)農(nóng)學(xué)卷;2007年02期

3 高剛;魯艷芹;韓金祥;趙麗;;雙啟動子對增強(qiáng)型綠色熒光蛋白表達(dá)的影響[J];中國生物制品學(xué)雜志;2009年10期

4 郝迪，

本文編號：600155