本文關(guān)鍵詞：金錢魚MHC Ⅱ β基因結(jié)構(gòu)、多態(tài)性與組織表達分析

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【摘要】：為探究金錢魚(Scatophagus argus)MHC Ⅱβ基因的結(jié)構(gòu)和特性,采用同源克隆和RACE等技術(shù),在獲得cDNA全序列的基礎(chǔ)上,分析其內(nèi)含子序列、基因多態(tài)性和組織表達情況。結(jié)果表明,金錢魚MHC IⅡβ基因cDNA序列全長1172 bp,其中5′UTR長34 bp,3′UTR長388 bp,開放閱讀框(ORF)長750 bp,編碼249個氨基酸,包含信號肽、β1結(jié)構(gòu)域、β2結(jié)構(gòu)域、連接肽(CP)、跨膜區(qū)(TM)和胞質(zhì)區(qū)(CYT);MHC Ⅱβ基因由6個外顯子和5個內(nèi)含子組成,其中內(nèi)含子3將β2結(jié)構(gòu)域分開。從43尾金錢魚的209個有效克隆中,獲得209條不同的核苷酸序列,可歸為48個等位基因主型,分別命名為Scar-DXB*0101~Scar-DXB*4801,揭示金錢魚MHC Ⅱβ基因的多態(tài)性很豐富。RT-PCR檢測發(fā)現(xiàn),金錢魚MHC Ⅱβ基因在所檢測的11種組織中均有表達,其中在脾、鰓、腸和皮膚中表達量較高,在腎、胃、心臟表達量中等,而在眼、腦、肝、肌肉中表達量較低。對健康金錢魚人工感染嗜水氣單胞菌后,發(fā)現(xiàn)其MHC Ⅱβ基因在肝、脾、鰓、腎等組織中的表達量均發(fā)生了不同程度的變化,證明該基因在金錢魚免疫反應(yīng)中有重要作用。在NJ法構(gòu)建的系統(tǒng)樹中,金錢魚與舌齒鱸、大西洋鮭等硬骨魚類的親緣關(guān)系相對較近,而與鉸口鯊、原雞、小鼠、人等的親緣關(guān)系則依次漸遠。
【作者單位】： 上海海洋大學(xué)省部共建水產(chǎn)種質(zhì)資源發(fā)掘與利用教育部重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 金錢魚 MHC Ⅱ β基因 基因結(jié)構(gòu) 多態(tài)性 組織表達
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(41176109)
【分類號】：S917.4
【正文快照】： 主要組織相容性復(fù)合體(majorhistocompatibility complex,MHC)由緊密連鎖的高度多態(tài)基因位點組成,存在于多數(shù)脊椎動物體內(nèi),且在機體的適應(yīng)性免疫中發(fā)揮非常重要的作用,因此一直受到國內(nèi)外研究者的關(guān)注。自Hashimoto等[1]于1990年首次報道了鯉(Cyprinuscarpio)的部分MHC基因序

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本文編號：513015