本文關(guān)鍵詞：大麥ARF基因家族的全基因組分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：生長素響應(yīng)因子(auxin response factor,ARF)基因家族是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子家族,在調(diào)控植物生長發(fā)育過程中起到重要作用。而關(guān)于大麥ARF基因家族全基因組分析的研究尚未見報(bào)道。為進(jìn)一步探討大麥ARF基因的功能,以公布的大麥栽培品種Morex的基因組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),采用生物信息學(xué)方法鑒定了大麥ARF基因,并對其結(jié)構(gòu)、染色體分布、蛋白保守結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進(jìn)化樹及表達(dá)譜進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,共鑒定出了17個大麥ARF基因,除4號染色體外,其余6條染色體上均有分布,片段復(fù)制事件是大麥ARF基因家族的主要擴(kuò)張方式;HvARF蛋白均具有保守的B3結(jié)構(gòu)域和Auxin_resp結(jié)構(gòu)域,而Aux/IAA結(jié)構(gòu)域僅存在于12個HvARF蛋白中,且不同蛋白所含該結(jié)構(gòu)域1~2個不等;不同植物中ARF基因在功能上具有保守性;不同組織器官中HvARF基因的表達(dá)存在明顯的差異。
【作者單位】： 江蘇省作物遺傳生理國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育點(diǎn)/糧食作物現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心/教育部植物功能基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/揚(yáng)州大學(xué)大麥研究所;
【關(guān)鍵詞】： 大麥 生長素響應(yīng)因子 進(jìn)化樹 表達(dá)譜
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31401370;31571648) 國家大麥青稞產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(CARS-05) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新基金項(xiàng)目(CX(14)2123) 江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程資助項(xiàng)目
【分類號】：S512.3
【正文快照】： 生長素響應(yīng)因子(auxin response factor,ARF)基因家族是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子家族,調(diào)控生長素響應(yīng)的基因表達(dá)[1-3]。絕大多數(shù)的ARF蛋白具有3個保守的結(jié)構(gòu)域,即N-末端B3DNA結(jié)合域(DNA-binding domain,DBD),具有DNA結(jié)合活性,能直接與生長素調(diào)控的下游基因啟動子區(qū)的AuxREs結(jié)合;中

【相似文獻(xiàn)】

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 劉艷;玉米全基因組ARF基因的分析及進(jìn)化研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

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本文編號：510175