本文關(guān)鍵詞：肺腺癌吸煙相關(guān)甲基化模式識別分類模型及特征基因的識別研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：吸煙是導(dǎo)致肺癌的一個重要誘導(dǎo)因素,從全基因組基因甲基化水平出發(fā),利用生物信息學(xué)方法,通過建立對當(dāng)前吸煙/不吸煙樣本的模式識別分類模型,識別甲基化特征基因,為揭示不吸煙肺癌患者的患病機理奠定基礎(chǔ)。為避免甲基化微陣列數(shù)據(jù)超高維小樣本、高噪聲、高相關(guān)性以及信息飽和現(xiàn)象淹沒真正的特征基因,首次采用迭代多重篩選方法,分別從顯著性差異、與基因表達(dá)水平的關(guān)系、生物功能、分類重要性等多個角度對全基因組甲基化數(shù)據(jù)進(jìn)行多步篩選,從而識別吸煙相關(guān)特征基因。以TCGA數(shù)據(jù)庫中127個肺腺癌樣本為訓(xùn)練集,64個EDRN肺腺癌樣本為獨立測試集,最終確定了48個關(guān)鍵基因。相應(yīng)模式識別模型對訓(xùn)練集精度達(dá)到87.5%(敏感性、特異性分別為87.2%和87.8%),獨立測試集分類精度達(dá)到76.4%(敏感性、特異性分別為80.2%和73.6%)。交叉研究表明,其中17個基因?qū)Π┌Y發(fā)展的重要性已經(jīng)在其他研究中有所證實,進(jìn)一步的研究則證明其甲基化的重要性。同時,KEGG和IPA對特征基因在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和代謝通路水平的分析表明,特征基因與癌癥的發(fā)展以及生物功能、細(xì)胞發(fā)育等都有著密切的聯(lián)系。
【作者單位】： 天津大學(xué)化工學(xué)院;大連醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院腫瘤科;德克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心;
【關(guān)鍵詞】： 肺腺癌 甲基化數(shù)據(jù) 吸煙史 模式識別 分類
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31271351)
【分類號】：R734.2
【正文快照】： 3(德克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心,美國達(dá)拉斯75235)引言吸煙是少數(shù)已知癌癥的相關(guān)危險因素之一,與肺癌、膀胱癌、食管癌等癌癥均有不同程度的聯(lián)系[1],尤其是吸煙與肺癌的聯(lián)系更是廣為人知。然而,最近的統(tǒng)計研究表明,25%的肺癌患者并非吸煙所致。不吸煙患者肺癌的致死率高居第7位,

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 常秀青 ,Tony Sheldon;低焦油含量香煙與肺腺癌發(fā)病率上升有關(guān)[J];英國醫(yī)學(xué)雜志(中文版);2002年01期

2 鄧小梅,何權(quán)瀛;細(xì)支氣管肺泡細(xì)胞癌與其他類型肺腺癌的對比分析[J];中國呼吸與危重監(jiān)護(hù)雜志;2005年03期

3 楊長青;王蓮芳;;飛行人員右肺腺癌1例[J];海軍醫(yī)學(xué)雜志;2006年04期

4 陳小兵;閆明;羅素霞;李寧;鄒宏志;韓黎麗;;84例青年肺腺癌早期誤診原因分析[J];實用診斷與治療雜志;2007年09期

5 陳小兵;閆明;曾軍杰;羅素霞;;青年女性肺腺癌首發(fā)癥狀及早期誤診原因分析[J];中國現(xiàn)代醫(yī)生;2009年06期

6 周琪;段亮;姜格寧;丁嘉安;;青年男性肺腺癌臨床特征對預(yù)后的影響[J];中國癌癥雜志;2009年08期

7 張文麗;;以高熱為首發(fā)癥狀的肺腺癌病例并文獻(xiàn)復(fù)習(xí)[J];甘肅醫(yī)藥;2013年07期

8 郭哲;肺腺癌病人的預(yù)防性頭顱照射[J];國外醫(yī)學(xué)(腫瘤學(xué)分冊);1988年06期

9 劉福升，李險峰，楊愛民，王彤;肺腺癌誤診肺結(jié)核16例分析[J];中國防癆雜志;1994年01期

10 余偉江;放療及合并化療治療Ⅲ期肺腺癌療效分析[J];腫瘤防治研究;1994年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 孫強;顧春東;雷霆;王金;李錦繡;;浸潤性周圍型小肺腺癌(≤2cm)不同病理亞型的比較[A];第13屆全國肺癌學(xué)術(shù)大會論文匯編[C];2013年

2 袁明遠(yuǎn);;周圍型肺腺癌病灶的放射學(xué)分類及其臨床價值[A];中華醫(yī)學(xué)會第16次全國放射學(xué)學(xué)術(shù)大會論文匯編[C];2009年

3 顧國浩;;生物芯片在肺腺癌診斷中的應(yīng)用進(jìn)展[A];中華醫(yī)學(xué)會第八次全國檢驗醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會議暨中華醫(yī)學(xué)會檢驗分會成立30周年慶典大會資料匯編[C];2009年

4 林嘉穎;吳一龍;楊學(xué)寧;喬貴賓;王坤;陳剛;;不同預(yù)后的肺腺癌患者酪氨酸激酶信號傳導(dǎo)通路異常的初步探討[A];第三屆中國腫瘤學(xué)術(shù)大會教育論文集[C];2004年

5 湯秀英;吳立紅;張燁;;肺腺癌的超微觀察及異質(zhì)性探討[A];第八次全國電子顯微學(xué)會議論文摘要集（Ⅰ）[C];1994年

6 徐芝君;應(yīng)可凈;;胸部CT基本正常肺腺癌伴慢性DIC一例并文獻(xiàn)復(fù)習(xí)[A];浙江省醫(yī)學(xué)會呼吸系病分會成立三十周年慶典活動暨2008年呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2008年

7 邵艷;洪偉俊;寧允葉;胥武劍;李強;;肺腺癌惡性轉(zhuǎn)化相關(guān)蛋白的初步篩查[A];中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)年會——2011（第十二次全國呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會議）論文匯編[C];2011年

8 王恩華;;解讀及評價國際多學(xué)科肺腺癌分類[A];2012年浙江省病理學(xué)學(xué)術(shù)年會論文集[C];2012年

9 宋正波;朱慧能;郭振英;吳偉;孫文勇;張沂平;;肺腺癌新分類在預(yù)測Ⅰ期非小細(xì)胞肺腺癌預(yù)后中的價值[A];第13屆全國肺癌學(xué)術(shù)大會論文匯編[C];2013年

10 趙燕妮;曹菊;牟向東;闕呈立;;肺腺癌影像反復(fù)波動病例報告一例并文獻(xiàn)復(fù)習(xí)[A];中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)年會——2013第十四次全國呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2013年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前8條

1 丁香;日發(fā)現(xiàn)肺腺癌的預(yù)測因子[N];中國醫(yī)藥報;2007年

2 仇逸邋孫國根;吸煙丈夫的妻子,患肺腺癌風(fēng)險高[N];新華每日電訊;2007年

3 曾理;肺腺癌早診研究關(guān)注“起源”[N];健康報;2008年

4 記者 李天舒　胡德榮;為何不吸煙者也患肺癌[N];健康報;2010年

5 記者 胡德榮;非吸煙肺腺癌人群致癌基因突變譜建立[N];健康報;2011年

6 高原;或與MiR-21分子有關(guān)[N];廣東科技報;2009年

7 海飛魚;探索肺癌突變基因[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報;2008年

8 健康時報記者 王志勝;一樣的腫瘤,不一樣治法[N];健康時報;2009年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 孫正亮;肺腺癌的分子分型特征及其與病理分型的關(guān)聯(lián)研究[D];復(fù)旦大學(xué);2014年

2 楊欣;肺腺癌預(yù)后相關(guān)的臨床病理因素分析及分子病理研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

3 鄭華;篩選肺腺癌相關(guān)血清自身抗體標(biāo)志物[D];北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所;2010年

4 張揚;肺腺癌致癌基因突變研究[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

5 張麗;基于IASLC/ATS/ERS國際多學(xué)科新分類的肺腺癌影像學(xué)及相關(guān)研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

6 楊繼要;肺腺癌腫瘤相關(guān)抗原的篩選鑒定及克隆表達(dá)[D];鄭州大學(xué);2006年

7 何萍;染色體15q25.1區(qū)域基因多態(tài)性與中國南方人群肺腺癌易感性的關(guān)聯(lián)研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2014年

8 李亞光;PI3K-Akt通路與肺腺癌術(shù)后患者預(yù)后的相關(guān)性研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2012年

9 趙偉鵬;肺腺癌淋巴管生成相關(guān)基因的篩選和初步鑒定[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2009年

10 劉亞嵐;水通道蛋白3在人體多種器官正常和癌組織中的表達(dá)及意義[D];中國醫(yī)科大學(xué);2007年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 蘇帆;rhPDCD5蛋白對肺腺癌A549細(xì)胞化療作用的研究[D];石河子大學(xué);2015年

2 卜靜;順鉑聯(lián)合雷帕霉素、3-MA對肺腺癌A549細(xì)胞及其裸鼠原位移植瘤的影響[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

3 韓承剛;寶石CT灌注成像在肺腺癌生物治療療效評價中的應(yīng)用價值[D];山西醫(yī)科大學(xué);2015年

4 展峰峰;肺腺癌患者組織中EML4-ALK融合基因與TYMS mRNA表達(dá)的關(guān)系[D];山西醫(yī)科大學(xué);2015年

5 趙玉澤;Ago2蛋白在EGFR突變的肺腺癌患者中的表達(dá)及臨床意義[D];山西醫(yī)科大學(xué);2015年

6 孫天宇;轉(zhuǎn)錄輔助因子4過表達(dá)與肺腺癌淋巴轉(zhuǎn)移和預(yù)后的相關(guān)性[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2015年

7 崔巍;肺腺癌患者外周血IL-17A~+T細(xì)胞和相關(guān)細(xì)胞因子檢測及意義[D];浙江大學(xué);2015年

8 趙鳳芝;bFGF單抗聯(lián)合Lobaplatin抑制肺腺癌細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移和誘導(dǎo)凋亡的機制研究[D];暨南大學(xué);2015年

9 邊猛;溫通法聯(lián)合化療對EGFR-TKIs耐藥后的脾腎陽虛型肺腺癌患者的臨床療效觀察[D];河南中醫(yī)學(xué)院;2015年

10 高正亞;Ⅰ期肺腺癌患者外周血和淋巴結(jié)中CK19及LUNX mRNA的表達(dá)與微轉(zhuǎn)移的相關(guān)性研究[D];蘇州大學(xué);2015年

  本文關(guān)鍵詞：肺腺癌吸煙相關(guān)甲基化模式識別分類模型及特征基因的識別研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號：463118