亞洲棉和雷蒙德氏棉MATE基因家族生物信息學(xué)及其同源基因在陸地棉中的表達(dá)分析
本文關(guān)鍵詞:亞洲棉和雷蒙德氏棉MATE基因家族生物信息學(xué)及其同源基因在陸地棉中的表達(dá)分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:多藥和有毒化合物排出(MATE)蛋白家族是1個(gè)次級(jí)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族。為了更好地了解亞洲棉和雷蒙德氏棉中MATE蛋白的種類和數(shù)量,利用2種二倍體棉花基因組的氨基酸和c DNA數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)MATE基因家族進(jìn)行篩選,并分析亞洲棉和雷蒙德氏棉全基因組中MATE基因的種類和進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果顯示,在亞洲棉基因組中初步鑒定了34個(gè)MATE基因,而在雷蒙德氏棉中篩選出42個(gè)MATE基因;蚪Y(jié)構(gòu)和系統(tǒng)進(jìn)化的比較分析表明,進(jìn)化關(guān)系近的MATE基因在結(jié)構(gòu)上基本是一致的。同時(shí)對(duì)陸地棉中克隆的Gh TT12及與其同一族的部分MATE基因進(jìn)行熒光定量分析,推測(cè)其所在同一族的MATE基因功能可能與轉(zhuǎn)運(yùn)原花青素有關(guān)。這些結(jié)果為進(jìn)一步深入分析棉花MATE基因的功能以及在原花青素轉(zhuǎn)運(yùn)中的作用提供了理論基礎(chǔ)。
【作者單位】: 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 亞洲棉 雷蒙德氏棉 陸地棉 MATE基因家族 基因結(jié)構(gòu) 系統(tǒng)進(jìn)化分析 熒光定量PCR
【基金】:安徽省“115”產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)(皖人才辦[2011]2號(hào)) 安徽省生物學(xué)重點(diǎn)學(xué)科(2014SWQJ009)
【分類號(hào)】:S562
【正文快照】: 彩色棉是1種棉纖維具有天然色彩的棉花。目前應(yīng)用的彩色棉主要包括棕色棉和綠色棉2大類,其中棕色棉色澤較穩(wěn)定、產(chǎn)量較高,是彩色棉的主要栽培品種[1]。但是,與白色棉相比,彩色棉纖維顏色類型單調(diào),色彩的自然穩(wěn)定性差、色澤變化較大,且產(chǎn)量低、纖維品質(zhì)較差[2],所以改善彩色棉
【相似文獻(xiàn)】
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本文關(guān)鍵詞:亞洲棉和雷蒙德氏棉MATE基因家族生物信息學(xué)及其同源基因在陸地棉中的表達(dá)分析,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):461149
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