灰飛虱攜帶的水稻條紋病毒NS2和NS3基因的分子變異
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【摘要】:為揭示灰飛虱攜帶水稻條紋病毒(rice stripe cirus,RSV)的NS2和NS3基因分子變異特征,采用單雌產(chǎn)卵法從江蘇、云南、山東、河北等地獲得20個灰飛虱攜帶的RSV分離物,RT-PCR擴增出NS2和NS3基因特異片段,并對擴增產(chǎn)物進行克隆測序,再結(jié)合Genbank中已報道的其他分離物序列,利用生物信息學軟件分析不同寄主、地區(qū)分高物的分子變異特點及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。序列測定表明,20個分離物NS2和NS3 2個基因核苷酸序列同源性分別為96.5%~100%(NS2)和95.4%~100%(NS3),推導編碼的蛋白氨基酸序列同源性為97.0%~100%(NS2)和96.2%~100%(NS3);诤塑账嵝蛄袠(gòu)建的系統(tǒng)進化樹分析表明2個基因均可以明顯分為2組,其中一組均為中國云南水稻上的分高物,2組間遺傳距離分別為0.05711(NS2)和0.06081(NS3),2基因的Z-test的檢測結(jié)果表明都處于強烈的負選擇壓下。從2基因氨基酸構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹和變異熱點上分析,其氨基酸序列的分子變異首先與地緣相關(guān),2基因均可以分成中國云南及云南以外的2個地理亞群;其次與寄主相關(guān),可以劃分為灰飛虱和水稻2個寄主群。
【作者單位】: 江蘇省農(nóng)業(yè)科學院植物保護研究所;
【關(guān)鍵詞】: 水稻條紋病毒 NS和NS基因 分子變異 寄主群 地理亞群
【基金】:國家自然科學基金(31201506) 國家公益性(農(nóng)業(yè))行業(yè)專項(201003031) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新項目[CX(13)5026]
【分類號】:S435.11
【正文快照】: 植物病毒的群體遺傳結(jié)構(gòu)不僅可為我們追蹤病 毒的起源、進化和流行途徑提供重要依據(jù),同時其遺傳結(jié)構(gòu)及演化機制還直接影響著病毒病害的發(fā)生、發(fā)展和控制。病毒病的發(fā)生和流行是寄主、病毒、介體以及環(huán)境等各因子相互作用的結(jié)果,各因子相互作用、相互制約形成了一^l''變化的植
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本文編號:452718
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